地黄枯草芽孢杆菌全基因组测序及其促生作用相关基因研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 腊贵晓

作者： 腊贵晓;王林林;郭军旗;赵玉龙;郭红霞;贾慧;杨铁钢

作者机构：

关键词： 枯草芽孢杆菌;地黄;全基因组测序;功能注释;内生菌;促生基因

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2024 年 53 卷 012 期

页码： 75-85

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究地黄枯草芽孢杆菌（Bacilus subtilis）对地黄促生作用的相关基因，对其进行全基因组测序，并通过功能注释挖掘促生作用相关基因。结果表明，地黄内生促生菌枯草芽孢杆菌基因组大小为4310 699 bp,GC含量为43.44%，共预测编码基因4 521个。GO、COG、KEGG、CAZy、CARD和VFDB数据库注释的基因数分别为3013、3354、4395、206、52、212。与促生作用有关基因有46个，这些基因主要集中在溶磷、固氮、铁载体等方面。同时，antiSMASH预测到共409个基因富集到12个次级代谢产物合成基因簇，主要编码合成丰原素、3-羧酸碳青霉烯、类双硫醇、杆菌溶素、羊毛硫类细菌素、表面活性肽、美好菌素酸和儿茶酚型嗜铁素等8种抑菌物质，其中美好菌素酸和儿茶酚型嗜铁素还具有螯合周围环境铁离子的作用。

分类号： S567.234

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