广西番茄花叶病毒和番茄褪绿病毒的分子鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李战彪

作者： 李战彪;莫翠萍;陈锦清;秦碧霞;崔丽贤;谢慧婷;蒋雅琴;汤亚飞;蔡健和

作者机构：

关键词： 番茄花叶病毒;番茄褪绿病毒;广西;小RNA深度测序;遗传进化分析

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2023 年 028 期

页码： 92-98

收录情况： CSCD

摘要： 为明确引起广西番茄呈现褪绿斑驳和花叶症状的病毒病原，采集4个疑似病毒感染的番茄样品，利用小RNA深度测序、RT-PCR、序列分析、遗传进化树的构建等方法对样品进行鉴定及遗传进化分析。研究结果发现，小RNA数据中的41条contigs分别被注释为番茄花叶病毒（tomato mosaic virus,ToMV）和番茄褪绿病毒（tomato chlorosis virus,ToCV）;RT-PCR证实了s RNA的结果，且所有样品均存在ToMV和To CV的复合侵染。通过拼接获得ToMV和ToCV RNA2的近全基因序列，ToMV近全基因序列为6383 bp，命名为ToMV-GX;ToCV RNA2的近全基因序列为8031 bp，命名为ToCV-GX。进化树分析发现，本研究获得的ToMV-GX与ToMV中国山西、内蒙古、呼和浩特3个分离物处于一个分支，说明其具有较近的亲缘关系；ToCV-GX与ToCV中国台湾、广东分离物处于一个大分支，说明具有较近的亲缘关系。上述结果证实，引起广西番茄呈现褪绿斑驳和花叶症状的病原是To MV和ToCV，本研究是ToMV和ToCV复合侵染广西番茄的首次报道。

分类号： S436.412.11

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