基于转录组测序的ITGAD基因InDel位点鉴定及其与山羊生长性状的关联性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴贤锋

作者： 吴贤锋;王金宝;刘远;池春梅;黄勤楼;李文杨

作者机构：

关键词： 山羊;β2整合素αD (ITGAD)基因;插入缺失(InDel);高分辨率熔解曲线(HRM);生长性状

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2022 年 30 卷 009 期

页码： 1763-1770

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： β2整合素αD(β2 integrinsαD,ITGAD)是一种异二聚体细胞表面受体的亚基,在调控脂肪新陈代谢和血糖平衡中发挥重要作用.为了加快山羊(Capra hircus)生长性状选育的遗传进展,为山羊生长性状的标记辅助选择(marker assisted selection,MAS)提供理论依据,本研究利用DNA池技术和高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析技术,检测了ITGAD基因在3个山羊品种(共355只)的插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)多态性,并分析其与山羊生长性状之间的关联效应.结果表明,检测到1个山羊ITGAD基因第15个内含子的新InDel位点(NC_030832.1:g.15243_15244 ins C),其多态信息含量(PIC)为0.289~0.369,并且该位点在3个品种中都处于哈迪-温伯格平衡状态;在与生长性状的关联分析中,该位点与福清山羊的尻宽和简阳大耳羊的体高、体长和胸围均显著相关(P<0.05),与简阳大耳羊的胸深、胸宽、管围、尻宽和管围指数极显著相关(P<0.01),并且II基因型个体显著优于DD基因型.本研究发现ITGAD基因InDel位点与山羊生长性状有显著的关联效应,为山羊生产性状的分子遗传标记选择提供参考依据.

分类号： S828.2

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