棉花WRKY转录因子家族成员的鉴定和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张书玲

作者： 张书玲;刘莹;张惠敏;刘浩然;董丽君;刘紫欣;刘建凤

作者机构：

关键词： 棉花;WRKY;鉴定;进化分析

期刊名称： 中国农业科技导报

ISSN： 1008-0864

年卷期： 2017 年 08 期

页码： 9-15

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WRKY转录因子家族在植物抵御各种生物、非生物胁迫反应和生长发育调控中扮演着重要角色。利用生物信息学方法鉴定和分析棉花A基因组WRKY转录因子,共鉴定得到109个候选WRKY基因,编码区全长474~3 528 bp,基因分布在棉花13条染色体上。依据WRKY家族基因的保守结构域和系统进化关系,将其划分为3个大组:G1组、G2组和G3组。G1组WRKY基因包括21个成员,其中18个含有两个WRKY域;G2组有73个成员,可进一步分为G2-a、G2-b、G2-c、G2-d和G2-e五个亚类;G3组WRKY基因包括15个成员。同组的WRKY成员保守域的氨基酸构成大体相似,但也存在WRKYGQK多肽和锌指结构的变异,不同组成员的氨基酸保守域组成特异。拟南芥和棉花WRKY基因的系统进化树表明,功能相似的基因聚在一起,暗示和拟南芥抗逆功能基因聚类在一起Ga WRKY可能参与棉花抵御逆境胁迫反应,为进一步发现和挖掘棉花WRKY基因的功能奠定理论基础。

分类号： Q943.2`S562

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