桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘勇
作者: 刘勇;王富荣;王会良;艾小艳;朱炜;孙中海;吕亮;龚林忠;何华平
作者机构:
关键词: 桃;流胶病;葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea);转录组测序;差异表达基因
期刊名称: 分子植物育种
ISSN:
年卷期: 2024 年 006 期
页码: 1842-1849
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为探讨桃响应葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea)侵染的分子机制,本研究以‘丰光’油桃作为研究材料,采用高通量测序技术对被B. dothidea侵染的桃枝干组织进行转录组测序,共筛选到1 463个差异表达基因(DEGs),其中上调911个,下调552个。差异表达基因注释到GO、KEGG数据库中的数目分别为1 231、255。GO功能分类结果显示DEGs主要富集在细胞组成、分子功能和生物学过程三个方面。细胞组成主要包括细胞组分、细胞、细胞器、膜等;分子功能主要集中于催化活性、核酸结合转录因子活性、转运活性、受体活性等;生物学过程主要富集在细胞过程、代谢过程、应激反应、生物调节等。KEGG分析结果表明差异表达基因涉及66个代谢途径,且主要富集在植物与病原互作、植物激素信号转导代谢通路。大量与植物抗病性、乙烯信号途径、钙信号途径相关的基因被B. dothidea侵染所激发。随机选取16个基因进行RT-qPCR定量分析,发现RT-qPCR结果与转录组测序结果趋势一致。本研究结果明确了桃响应B. dothidea侵染过程中相关基因的表达情况,为深入研究病原物的致病机理提供参考依据。
分类号: S436.621.1
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