苦瓜Bryodin Ⅱ-like RIP生物信息学分析及原核表达载体的构建

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王煜琪

作者: 王煜琪;姚春鹏;张晓爱

作者机构:

关键词: 苦瓜;核糖体失活蛋白;生物信息学分析;原核表达载体

期刊名称: 黑龙江科学

ISSN: 1674-8646

年卷期: 2025 年 16 卷 018 期

页码: 10-14

摘要: 为构建苦瓜BryodinⅡ-likeRIP原核表达载体并进行生物信息学分析,通过CugenDB数据库的苦瓜(OHB3-1)v2基因组获得目的基因CDS序列,结合NCBI数据库的氨基酸序列,利用生物信息学软件预测其结构与功能。以苦瓜全基因组cDNA为模板,PCR扩增目的基因后,通过SacⅠ和SalⅠ双酶切,经T4连接酶连接后转入大肠杆菌DH5α感受态。结果显示,保守结构域分析可知该蛋白属于Ⅰ型核糖体失活蛋白,与α-苦瓜素、β-苦瓜素、MAP30和苦瓜凝集素等典型苦瓜RIPs的核苷酸序列同源性为48.6%~58.5%(氨基酸序列同源性为30.8%~45.5%),成功扩增出与预期大小相符的目的基因,重组质粒经菌落PCR及测序验证苦瓜BryodinⅡ-likeRIP与原核表达载体pET-28a(+)正确连接,生物信息学分析该蛋白具备RIP典型功能域,属于RIP家族,并成功构建苦瓜BryodinⅡ-likeRIP原核表达载体。

分类号: S642.5%Q943.2

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