石斑鱼属鱼类线粒体基因组序列特征及系统发育信息评估

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄小林

作者： 黄小林;吕国敏;刘付永忠;李涛;蔡云川;马志洲;黄忠

作者机构：

关键词： 石斑鱼属;线粒体基因组;系统发育信息;分子标记

期刊名称： 生物学杂志

ISSN： 2095-1736

年卷期： 2013 年 30 卷 03 期

页码： 9-13

收录情况： CSCD

摘要： 通过生物信息学方法,比较分析了已登录到GenBank中的6条石斑鱼和1条豹纹鳃棘鲈的线粒体基因组序列,初步揭示了石斑鱼属线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因、差异位点、选择压力及系统发育等信息。结果表明:1)与大多数脊椎动物一样,石斑鱼属鱼类线粒体基因组均编码37个基因,基因排列顺序与其它硬骨鱼类一致,其中,基因差异位点比例最大为ND6(33.9%),16SrRNA的差异位点比例最小(13.5%);2)6条石斑鱼线粒体基因组中,所有13个蛋白质编码基因的Tajima’s D检测均为不显著的负值,且Ka/Ks均远小于1,都显示出较强的净化选择作用;3)结合分子系统树的置信度和与序列的信息量,对石斑鱼线粒体13个蛋白质编码基因在属内种间的系统进化分析能力进行了评估,结果表明Cytb和ND2基因是理想的分子标记。

分类号： Q951.3

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