大薯ERF基因家族的挖掘与特征

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张金兰

作者： 张金兰;张博;黄东益;肖勇;吴文嫱;许云;黄小龙;夏薇

作者机构：

关键词： 大薯(Dioscorea alata L.);ERF;基因家族

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2019 年 07 期

页码： 2086-2093

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 大薯属于薯蓣科薯蓣属,是热带和亚热带地区的一种重要的粮食作物,但其基础研究还较为薄弱。本研究基于公布的大薯转录谱序列和基因组序列,开展了对大薯ERF家族基因的挖掘和特征分析。共找到DaERF基因41个,其中14个DaERF有一个以上的外显子,其余的均为一个外显子。进一步的blastx分析发现30个DaERF基因具有保守的AP2结构域,依据AP2序列构建系统进化树,可将其分成5个亚家族。通过对AP2结构域的两个保守motif的位置和结合位点的分析,发现相同家族的ERF蛋白具有相似的结构特征。根据大薯转录谱分析DaERF在不同组织中的表达,发现一些DaERF的表达具有组织特异性,并且属于同一亚家族基因的表达具有相似性。我们对在块茎中具有高表达的DaERF-DaERF24基因,使用RT-qPCR验证其在不同组织的表达,结果与转录谱数据一致。本研究通过对大薯ERF转录因子家族特性的初步挖掘,为以后研究ERF家族全基因分布、ERF基因功能验证和薯块生长发育机理提供依据。

分类号： S632.1

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