基于小RNA深度测序技术对呼和浩特地区紫花苜蓿病毒病病原检测及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈方淇

作者： 陈方淇;王乐;吴杰;贾瑞芳;张园园;赵君;陈正强;林克剑

作者机构：

关键词： 紫花苜蓿;苜蓿病毒病;小RNA深度测序;系统进化分析

期刊名称： 中国草地学报

ISSN： 1673-5021

年卷期： 2024 年 46 卷 009 期

页码： 76-86

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 内蒙古地区是我国紫花苜蓿主产区之一，苜蓿病毒病的大面积发生严重影响了内蒙古地区紫花苜蓿的产量和质量。本研究利用小RNA深度测序技术结合RT-PCR/PCR，对内蒙古呼和浩特地区采集的8份紫花苜蓿病样进行病原鉴定，结果表明8份病样被苜蓿花叶病毒（AMV）、紫花苜蓿alpha双生病毒1(MsAPV1)、紫花苜蓿alpha双生病毒2(MsAPV2)、紫花苜蓿amavirus病毒1(MsAV1)和紫花苜蓿delta双生病毒1(MsDPV1)5种病毒所侵染，检出率分别为25.0%、75.0%、50.0%、37.5%、62.5%。样品1、3、4、6、7、8被两种以上的病毒复合侵染，其中样品4受到5种病毒的复合侵染。对5种病毒进行核苷酸系统进化分析，结果显示呼和浩特地区紫花苜蓿病毒分离物AMV/PP080165、MsAPV1/PP100171、MsAPV2/PP100172、MsAV1/PP100173和MsDPV1/PP100174分别与AMV/MZ22178.1、MsAPV1/MT787573.1、MsAPV2/MZ221805.1、MsAV1/OL521710.1和MsDPV1/ON669073.1亲缘关系最近。本研究首次对呼和浩特地区紫花苜蓿病毒病进行系统鉴定和分析，为进一步研究内蒙古地区紫花苜蓿病毒病病原的遗传进化和防治奠定了基础。

分类号： S435.4

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