文献类型： 中文期刊
第一作者： 施友志
作者： 施友志;申民翀;王剑;潘勇;杜甫;纪桂霞;赵泽玉;李子玮;王琰琰;贾志忠;袁晓龙;吴创
作者机构：
关键词： 雪茄;叶绿体基因组;系统进化关系;种质资源
期刊名称： 特产研究
ISSN： 1001-4721
年卷期： 2025 年 47 卷 001 期
页码： 59-66,78
摘要： 为探究国内栽培雪茄烟的品系来源，本研究采用第二代测序技术对6种雪茄烟的叶绿体基因组进行了测序和组装，解析了其叶绿体基因组的结构特点，并构建其系统进化关系。结果表明，6种雪茄烟具有典型的叶绿体基因组的4个分区：大单拷贝区（Large single copy, LSC）、小单拷贝区（Small single copy, SSC）和一对反向重复区（Inverted repeat, IRa/IRb）。结果表明，Nicotiana tabacum 7-CX14,N. tabacum Hainan2, N. tabacum Hainan3,N. tabacum 189802E-Habana2000,N. tabacum Piloto Cubano和N. tabacum apxA＿T2＿120719的叶绿体基因组全长分别为155942 bp,155942 bp,155942 bp,155942 bp,155942 bp和161907bp，包括86685p～86686 bp的LSC区域，18571～18 573 bp的LSC区域。除N. tabacum apxA＿T2＿120719之外，其余5种雪茄烟的叶绿体基因组编码的基因数目均为130个，包含85个蛋白编码基因（Protein-coding genes, PCGs）、8个核糖体RNAs(ribosomal RNAs, rRNAs)、37个转运RNAs(transfer RNAs, tRNAs)。N. tabacum apxA＿T2＿120719包含109个蛋白质编码基因，39个t RNAs。6个物种基因组序列长度差异不大，LSC/IR和SSC/IR边界基因的位置和类型也非常保守。叶绿体基因组中共有60个简单重复序列（SSRs），在密码子的使用上存在A或T偏好。系统进化树的结果表明，来源于湖北省十堰市丹江口市的N. tabacum7-CX14与来源于多米尼加的N. tabacum Piloto Cubano聚为一支，表明我国栽培的雪茄烟可能存在同种异名、异名同种的现象。因此，雪茄烟叶绿体基因组的测定将有助于雪茄烟物种的鉴定、DNA条形码的开发，可为将来的育种提供科学参考。
分类号： S572
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