新疆地区犊牛冠状病毒的病原调查及S基因的遗传进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 贾开文
作者: 贾开文;操义恒;胡亚辉;党士荣;钟发钢;赵文娟;吴桐忠;韩猛立;张星星;张倩;周霞;黄新
作者机构:
关键词: 牛冠状病毒;流行病学调查;S基因;遗传进化分析
期刊名称: 中国兽医学报
ISSN: 1005-4545
年卷期: 2024 年 004 期
页码: 664-669
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采集了新疆8个地区15个牛场421份4月龄内犊牛的肛拭子,应用RT-PCR方法扩增牛冠状病毒(bovine coronavirus, BCoV)N基因和S基因,对S基因蛋白序列进行遗传进化分析。结果显示,BCoV个体核酸阳性率为19.91%(67/421),7~30日龄犊牛阳性率为33.59%(44/131),有临床腹泻症状犊牛的核酸阳性率为18.21%(57/313),伊犁地区最高34.88%(15/43);获得3条S基因序列,全长分别为4 092、4 092、4 093 bp,与参考序列核苷酸同源性为98.88%~99.46%;遗传进化分析显示3条S基因与国内四川毒株SWUN/NMG-13(MW711304.1)和BCOV-China/SWUN/LN4(MK095182.1)核苷酸同源性最近,为99.3%~99.4%,均属于GⅡ型;与国内外17株参考毒株相比,所测毒株存在23个氨基酸位点突变,均在I113V、D115A、S501P和T510S位点出现突变。结果表明,新疆地区1~4月龄犊牛普遍存在BCoV感染,且S蛋白存在部分突变。本研究揭示了新疆牛场犊牛BCoV不同月龄和地域流行分布及其S蛋白的变异特征,为BCoV防制提供了依据。
分类号: S852.65
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