玉蜀黍属植物叶绿体基因组进化及变异研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马闯

作者： 马闯;贾民隆;王杰;彭丹;邢国芳;武志强

作者机构：

关键词： 叶绿体基因组;玉蜀黍属;进化;系统发育

期刊名称： 东北农业大学学报

ISSN： 1005-9369

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 13-27

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 玉蜀黍属（Zea）又名玉米属，包含玉蜀黍（俗称玉米，Z. mays）及其野生种，是全球重要谷物之一，也是基础研究的模式植物。为深入解析该属物种系统发育关系和遗传变异规律，研究利用NCBI已发表的201个玉蜀黍属植物Illumina二代测序数据，通过组装、注释和分析，全面探究玉蜀黍属植物叶绿体基因组。结果表明，玉蜀黍属叶绿体基因组呈典型的环状四分体结构，全长为140 443～141 050 bp,GC含量为38.4%，共有128个基因被注释；密码子偏好性分析发现，玉米与其他物种差异明显，尤其对UUA密码子偏好性最明显；玉米与其他物种重复序列总体上无明显差异，但在简单重复序列类型中，玉米与其他物种区别较大；所有样本在系统发育分析中被分为四组，共鉴定出79个单倍型，同一组样本聚集，主成分分析结果支持不同组的样本可清晰分开；核苷酸多态性分析准确定位了10个高变位点，可作为潜在的DNA条形码。综上，研究揭示了201个玉蜀黍属植物叶绿体基因组之间的遗传变异和系统进化关系，为加速玉米育种进程提供了细胞器遗传基因组的新视角。

分类号： S513

  • 相关文献

[1]小檗属植物叶绿体基因组序列结构及系统发育分析. 李述成,郭生虎,贝盏临. 2022

[2]茶树叶绿体基因组的研究与应用进展. 杨雨青,谭娟,汪芳,彭顺利,陈婕,谭明燕,吕美艳,周富裕,刘声传. 2024

[3]叶绿体基因组研究进展. 邢少辰,CLARKE JIHONG LIU. 2008

[4]芹菜和细叶旱芹叶绿体基因组结构特征与系统进化分析. 杜佳庚,李晓燕,李威龙,谭国飞,熊爱生,李梦瑶. 2024

[5]彩色花椰菜叶绿体全基因组特征分析. 朱惠霞,陶兴林,刘明霞. 2023

[6]杂花苜蓿叶绿体基因组特征及系统发育分析. 郝新艳,赵淑文,刘嘉伟,石蕊,王晓龙,李迎,王晓宇,米福贵. 2023

[7]濒危植物峨眉凤仙花叶绿体基因组分析. 赵秋燕,曹孟会,李新艺,周敏,魏春梅,张茜,瞿素萍,黄海泉,黄美娟. 2023

[8]多叶勾儿茶叶绿体基因组比较分析及系统发育研究. 刘畅,曾宪法,杨小英,赵宇,张涛,周思旋. 2023

[9]胡颓子科叶绿体基因组系统发育分析与演化趋势推断. 罗晗睿,王罗云,张建国,曾艳飞. 2024

[10]倒刺狗尾草叶绿体基因组特征及系统发育分析. 刁玉霖,李竑阳,张海金,张文飞,王凯玺,朱康宁,张蒙,孙鑫,李前,陈国秋. 2024

[11]黄花型扁蓿豆叶绿体基因组及其系统发育分析. 温静,郭茂伟,朱琳,李志勇,李鸿雁,魏鹏,闫慧芳,赵诚贵. 2024

[12]古菌、细菌和真核生物纤维素酶的整体进化关系（英文）. 吴光. 2016

[13]中国鹿类动物分类及系统进化研究进展. 刘汇涛,董依萌,王磊,周永娜,邢秀梅,杨福合. 2017

[14]长囊水云叶绿体基因组密码子使用特征分析. 刘福利,王飞久,邵展茹. 2012

[15]贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析. 兰青阔,赵新,陈锐,王成,陈笑芸,汪小福,王永,兰璞. 2020

[16]木薯叶绿体基因组密码子偏好性分析. 赵英,付海天,金刚,徐钏,宋恩亮,罗燕春,莫永龙. 2022

[17]黑喉石斛叶绿体基因组特征及比较分析. 杜致辉,杨澜,张朝君,许红娟,陈之林. 2021

[18]禾本科主要农作物叶绿体基因组研究进展. 李裕华,任永康,赵兴华,刘江,韩斌,王长彪,唐朝晖. 2020

[19]构建结球甘蓝KIN基因在叶绿体基因组定点表达的载体. 陶鹏,黄小云,李必元,王五宏,岳智臣. 2015

[20]桑叶葡萄叶绿体基因组及其特征分析. 杨亚蒙,焦健,樊秀彩,张颖,姜建福,李民,刘崇怀. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序