紫花苜蓿几丁质酶ClassⅢ基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张文娟

作者： 张文娟;李聪;王涌鑫;苗丽宏

作者机构：

关键词： 紫花苜蓿;几丁质酶;ClassⅢ基因;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2010 年 8 卷 02 期

页码： 71-75

收录情况： CSCD

摘要： 本文根据截叶苜蓿(Medicago truc atula)几丁质酶ClassⅢ基因(GenBank:AY294484.1)的全长序列设计引物,通过RT-PCR的方法得到紫花苜蓿(Medicago sative)几丁质酶ClassⅢ的核酸序列,命名为MsChiⅢ,在NCBI中的登录号为FJ872918。利用生物信息学软件分析MsChiⅢ,预测氨基酸序列的等电点、二级结构和三级结构,并构建系统发育树。结果显示该核酸序列全长为953bp,包括完整的开放阅读框,编码301个氨基酸,等电点为8.212。该序列所编码的蛋白属于几丁质酶18家族的内切酶,分布于细胞间隙,并含有几丁质酶18家族的特征序列——LGDVDFDIE,并预测MschiⅢ可能是一种具有几丁质酶和溶菌酶的双功能酶。

分类号： S541.9`Q943.2

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