猪繁殖与呼吸综合征病毒TJM株5'和3'非翻译区克隆与测序

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘莹

作者： 刘莹;王凤雪;温永俊;武华

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;5'非翻译区;3'非翻译区;cDNA末端快速扩增

期刊名称： 动物医学进展

ISSN： 1007-5038

年卷期： 2014 年 35 卷 9 期

页码： 1-5

收录情况： CSCD

摘要： 为了获得猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) TJM株5'非翻译区(5'UTR)和3' 非翻译区(3'UTR)的准确序列,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术进行克隆测序。结果表明, 5'和3'末端快速扩增技术(5'RACE 和3'RACE)能很好地扩增猪繁殖与呼吸综合征病毒的末端序列,分别获得长度为493 bp和750 bp的片段。与NCBI中已发表的原野毒株TJ株序列(EU860248.1)及其他毒株比对分析发现,TJM株5'UTR较TJ株有4处突变,突变后与XJu-1株序列完全一致,其中,前3处突变与许多亚洲毒株相同,3'UTR序列没有改变。通过预测RNA二级结构发现,TJM株5'UTR核苷酸序列的改变能够影响RNA二级结构,而该二级结构是病毒复制和拯救的关键。TJM株5'和3'末端序列的获得,为病毒基因组功能结构分析和全长感染性克隆的构建奠定了基础。

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