中国柑橘黄龙病病原菌两个原噬菌体超变异基因遗传多样性

文献类型: 中文期刊

第一作者: 谭锦

作者: 谭锦;王雪峰;苏华楠;李中安;周常勇

作者机构:

关键词: 柑橘黄龙病;原噬菌体;重复序列;遗传多样性

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2013 年 46 卷 18 期

页码: 3784-3792

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】通过原噬菌体区域高度变异的基因位点研究柑橘黄龙病病原菌亚洲种(‘Candidatus Liberibacter asiaticus’)的种群分化,探讨病原菌种群遗传多样性水平和遗传结构。【方法】基于2种原噬菌体类型(SC1和SC2)对应的超变异基因区域设计2对引物(Lap-TJ-F/Lap-TJ-R1和Lap-TJ-F/Lap-TJ-R2),对中国不同柑橘产区的224个‘Ca.L.asiaticus’株系进行PCR检测和序列分析。【结果】PCR扩增的条带类型呈多态性,具有4种条带类型(SC1-1、SC1-2、SC2-1和SC2-2),西南地区以SC1-1型为主,广东、广西地区以SC2-1型为主,福建、江西、浙江地区没有明显优势的扩增型。分析SC1-1和SC1-2对应序列表明,其差异系由于132 bp的卫星序列和24 bp的小卫星序列2种串联重复序列数不同引起,而SC2-1和SC2-2的差异系由原噬菌体内部基因重排引起。【结论】中国不同地理来源病原菌株系在原噬菌体区域具有较丰富的多态性,对该基因区域研究将有助于揭示中国‘Ca.L.asiaticus’种群的遗传多样性。

分类号: S436.66

  • 相关文献

[1]贵州南部柑桔黄龙病菌两个原噬菌体位点遗传多样性分析. 柏自琴,王小柯,冯建文,李金强,罗会,罗怿,李兴忠,李文云,马玉华. 2019

[2]一株含有5个原噬菌体的单增李斯特菌比较基因组分析. 王旭,李骏,张昭寰,潘迎捷,欧竑宇. 2017

[3]五种鲟鱼线粒体控制区异质性和系统发育分析. 王巍,朱华,胡红霞,田照辉,董颖. 2009

[4]甘薯属耐盐植物马鞍藤基因组大小及特征分析. 霍恺森,赵冬兰,陈艳丽,周志林,王珧,唐君,朱国鹏,曹清河. 2019

[5]小麦条锈菌一个中度重复DNA序列家族的鉴定. 张耕耘,单卫星,李振岐,吴立人. 1997

[6]我国小麦条锈菌模式菌系的DNA指纹分析. 陈受宜,惠东威,吴立人,李振岐. 1996

[7]木贼镰孢菌D25-1全基因组序列的测定及结构分析. 李雪萍,李建宏,漆永红,郭成,李潇,李敏权. 2019

[8]木本高山花卉马缨杜鹃的全基因组扫描分析. 张露,李世峰,宋杰,解玮佳,彭绿春,李树发,王继华. 2018

[9]三疣梭子蟹基因组小卫星特征分析. 宋来鹏,刘萍,李健,刘振辉. 2008

[10]植物转基因沉默机制及消除对策. 王红梅,张献龙,蔡忠民,李运海,刘方. 2003

[11]植物线粒体结构基因组研究进展. 苏爱国,李双双,王玉美,雷彬彬,刘国政,康定明,华金平. 2011

[12]昆虫基因组组装大小偏差的原因解析. 丛宇阳,贺康,舒润国,程梓淇,陈昊,王亚琴,李飞. 2021

[13]新疆巴贝斯虫棒状体相关蛋白(RAP-1):多个不同3′末端重复序列的基因拷贝. 牛庆丽,MarchandJordan,杨聪山,BonsergentClaire,关贵全,殷宏,LaurenceMalandrin. 2015

[14]高等植物线粒体基因组研究进展. 张晓,张锐,侯思宇,史计,郭三堆. 2011

[15]高等植物着丝粒序列的结构与特征研究. 夏薇,李静,周丽霞,杨耀东,肖勇,马子龙. 2014

[16]鲤基因组中1个新Tcl类转座子的发现与鉴定. 王全乐,冀培丰,徐鹏,孙效文. 2011

[17]雷蒙德氏棉一段单拷贝序列的FISH分析. 徐俊民,刘玉玲,刘方,高巧丽,彭仁海,王春英,周忠丽,王星星. 2016

[18]藜属植物叶绿体基因组结构与系统进化. 蒋礼玲,王琳超,黄新荣,杨宇若,王明雪,贾举庆,黄胜雄. 2022

[19]几种菊属植物的基因组大小测定及其重复序列成分分析. 钱双,赵鑫,杨树华,贾瑞冬,葛红. 2015

[20]同一SSR引物在不同棉种BAC文库中的筛选及其FISH分析. 徐俊民,崔兴雷,刘玉玲,彭仁海,周忠丽,蔡小彦,王坤波,刘方. 2019

作者其他论文 更多>>