高粱耐冷基因全基因组鉴定及进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张国琴

作者： 张国琴;葛玉彬;张正英

作者机构：

关键词： 高粱;耐冷基因;全基因组鉴定;进化分析

期刊名称： 甘肃农业科技

ISSN： 1001-1463

年卷期： 2020 年 012 期

页码： 37-41

摘要： 利用公布的高粱全基因组数据,以及BLAST、Pfam、MEGA6.0等生物信息学软件对高粱相关耐冷基因数量、 系统进化树进行分析.结果表明,在高粱全基因组中共有AP2家族基因203个、ICE1基因252个、EIN3基因15个、SNAC2基因133个、AMP1基因3个、COLD1基因3个、qLTG3-1基因53个、ctb1基因90个.通过进化树分析,高粱中XP002457016.1、XP021-317625.1;XP002463411.2、XP002467935.1、XP021317527.1;XP002447111.1、XP021-315473.1、XP002447110.1、XP021318475.1、XP021318476.1;XP002449576.1、XP002459022.1;XP002466328.1;XP021317902.1;XP002446618.1、XP002452340.1和XP021314112.1基因与模式作物中AP2基因家族、AtEIN3、Osctb1、OsqLTG3-1、AtAMP1、OsCOLD1、OsSNAC2亲缘关系最近,主要分布在高粱1、2、3、4、5、6号染色体.综合分析,在高粱全基因组中耐冷转录因子(AP2、EIN3、ICE1、SNAC2)拷贝数较多,与模式作物耐冷基因亲缘关系最近的基因主要分布在高粱1、3、5号染色体,耐冷功能基因(COLD1、qLTG3-1、ctb1、AMP1)拷贝数较少,与模式作物耐冷基因亲缘关系最近的基因主要分布在1、4、6号染色体.

分类号： S514

  • 相关文献

[1]砀山酥梨TCP基因家族全基因组鉴定与分析. 冀志蕊,董庆龙,谷彦冰,吴建圆,迟福梅,徐成楠,张俊祥,乔壮,周宗山. 2017

[2]葡萄TCP基因家族全基因组鉴定和分析. 冀志蕊,谷彦冰,董庆龙,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山. 2015

[3]高粱GATA基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 宋迎辉,朱灿灿,代书桃,秦娜,王春义,张真,李君霞,平西栓. 2022

[4]高粱CIPK家族基因的全基因组鉴定及非生物胁迫下的表达特征. 徐鹏,李春宏,范昕琦,梁笃,沈新莲. 2024

[5]高粱LBD基因家族的鉴定及苗期干旱胁迫表达分析. 宋迎辉,付森杰,朱灿灿,代书桃,秦娜,景雅,张真,薛淑霞,李君霞. 2024

[6]高粱Dof基因家族鉴定及表达分析. 付森杰,宋迎辉,朱灿灿,叶珍言,秦娜,代书桃,刘海霞,王春义,李君霞. 2025

[7]高粱隐花色素CRY基因家族鉴定与表达分析. 果永超,王志芳,焦志银,王金萍,石燕楠,牛敬田,王新玉,刘皓然,张静,吕芃. 2024

[8]辣椒应答冷信号转导机制研究进展. 潘宝贵,钱恒彦,戈伟,刘金兵,郭广君,刁卫平,王述彬. 2019

[9]黄瓜耐冷相关基因的表达分析. 董洪霞,沈镝,李锡香,宋江萍. 2017

[10]应用近等基因系初步定位粳稻孕穗期的耐冷基因. 申时全,曾亚文,李绅崇,文国松,普晓英. 2005

[11]利用基因工程技术提高水稻耐冷性的研究进展. 李莹,周雷,潘英华,姚国新,任银玲. 2015

[12]水稻穗期耐冷性近等基因等的选育及耐冷性遗传研究. 曾亚文,叶昌荣. 2001

[13]基于引物扩增受阻突变技术开发水稻耐冷基因CTB4a特异性分子标记. 梁海福,潘英华,刘开强,邓国富,黄娟,卿东进,高菊,伍豪,高利军. 2021

[14]水稻穗期耐冷性近等基因系的选育及耐冷性遗传研究. 曾亚文,叶昌荣,申时全. 2001

[15]岩棉及施用硅肥对水稻秧苗生长及耐低温特性的影响. 陈 玉林,张 义凯,陈 惠哲,向 镜,盛 和深,杨 运辉,田 小海,张 玉屏. 2025

[16]小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析. 徐武,刘建丰,张戈,徐文,袁祖丽. 2019

[17]辣椒BES1基因家族鉴定及表达分析. 孟纯阳,魏小春,赵艳艳,原玉香,王志勇,杨双娟,姜俊,张晓伟. 2019

[18]菜用大豆液泡膜内在蛋白(TIPs)基因鉴定及表达分析. 冯志娟,徐盛春,刘娜,张古文,胡齐赞,龚亚明. 2018

[19]大豆分枝相关CYC/TB1-Like(CYL)基因鉴定及菜用大豆品种的激素表达谱分析. 冯志娟,刘娜,张古文,徐盛春,龚亚明. 2019

[20]葡萄CHX基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 杜宜洋,连红娟,李晓梅,谭敏,杨镕兆,刘政海,杨兆亮,唐晓萍,董志刚,李捷. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序