蓖麻NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 代梦媛

作者： 代梦媛;高梅;李文昌

作者机构：

关键词： 蓖麻;抗逆性;NAC转录因子;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 006 期

页码： 1808-1817

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： NAC蛋白是植物特有的转录因子大家族,作用于植物生长发育和逆境胁迫响应,本研究基于蓖麻全基因组数据,利用生物信息学分析方法对蓖麻NAC转录因子家族成员、系统发育、编码蛋白的结构和理化性质进行分析.蓖麻NAC转录因子家族包括91个成员,分为14个亚族,其中蓖麻NAC转录因子Ⅻ亚族和Ⅻ亚族为蓖麻特有NAC蛋白;基因结构分析显示内含子数量为2~5个,Ⅻ亚族中12个成员缺少内含子;蛋白结构域分析显示Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四个亚族蛋白质序列5个结构域(Motif)保守性较强,motif 2几乎存在所有蓖麻NAC蛋白中;与拟南芥105个NAC成员构建系统发育进化树,蓖麻58个NAC蛋白分别聚类到38个OGs,NAC转录因子的40个OGs中蓖麻缺少OG3b和OG7f;理化性质和结构分析显示蓖麻NAC蛋白质绝大多数是亲水氨基酸,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构大部分相似.蓖麻具有很强的抗逆境胁迫能力,本研究为蓖麻耐性相关的NAC转录因子调控机理研究提供了科学依据.

分类号： Q943.2%S565.6

  • 相关文献

[1]水稻NAC转录因子家族的研究进展. 赵才美,黄兴奇,殷富有,李定琴,陈越,陈玲,程在全. 2020

[2]亚洲棉全基因组中NAC类转录因子基因的鉴定与分析. 赵灿,刘任重,柳展基,李菲,王立国,马骏骏,朱新霞. 2015

[3]蓖麻GRF转录因子家族生物信息学鉴定及表达分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2021

[4]蓖麻DNA甲基转移酶序列与基因表达分析. 代梦媛,高梅,郭丽芬,邓剑川,李文昌. 2016

[5]蓖麻RcNAC100-like基因克隆及表达特性分析. 李艳肖,王丽娜,朱贵爽,刘鹏,向殿军. 2024

[6]蓖麻赤霉素氧化酶基因的全基因组鉴定和表达分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2022

[7]蓖麻WRKY基因的电子克隆及其生物信息学分析. 杨鹏雅,李开绵,周建国,王文泉. 2009

[8]NAC转录因子在植物抗非生物胁迫基因工程中的应用进展. 段俊枝,李莹,赵明忠,李清州,张莉,魏小春,任银铃. 2017

[9]NAC转录因子在水稻抗逆基因工程中的应用进展. 段俊枝,李莹,赵明忠,魏小春,任银铃. 2017

[10]‘南林895’杨PdNAC1基因克隆及蛋白的亚细胞定位. 王浩然,邵志龙,朱燕宇,匡华琳,黄敏仁. 2015

[11]植物NAC转录因子的研究进展. 冶晓芳,唐益苗,高世庆,杨颖,刘美英,王永波,赵昌平. 2009

[12]大豆转录因子GmNAC2a基因克隆及表达. 韩巧玲,曹新有,陈明,陈耀锋,李连城. 2011

[13]NAC转录因子在植物抗病和抗非生物胁迫反应中的作用. 孙利军,李大勇,张慧娟,宋凤鸣. 2012

[14]日本结缕草ZjNAC2基因的克隆、亚细胞定位及表达分析. 姜红岩,张蕊,滕珂,檀鹏辉,刘凌云,尹淑霞. 2019

[15]哈氏黄瓜NAC转录因子的鉴定及低温表达分析. 赵艳青,杜建厂,王盼乔,秦晓东,陈劲枫. 2019

[16]辣椒疫病抗性相关NAC基因的鉴定及表达分析. 刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,郭广君,戈伟,高长洲. 2018

[17]菠萝NAC转录因子基因AcoNAC1生物信息学及表达分析. 谭秦亮,蔡元保,杨祥燕,李穆,李季东,黄思婕,程琴,庞新华,朱鹏锦,周全光. 2021

[18]番茄NAC转录因子SlNAC80的克隆及表达分析. 刘辉,王涛涛,张俊红,欧阳波,李汉霞. 2015

[19]小麦TaNAC-B072基因的克隆和表达分析. 陈文烨,杨帆,刘永伟,董福双,赵和,柴建芳,吕孟雨,周硕. 2020

[20]欧洲葡萄'粉红亚都蜜'NAC基因DRL1负向调节植物抗旱性. 朱自果,阴启忠,张庆田,韩真,张倩,李勃. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序