大豆瘪荚率的遗传解析及其遗传位点的关联分析定位

文献类型: 中文期刊

第一作者: 耿雅婷

作者: 耿雅婷;王俊;高华伟;杨梦园;张湘;李敏敏;于倩倩;王淑蕾;刘立科

作者机构:

关键词: 大豆;瘪荚率;广义遗传;全基因组;关联分析

期刊名称: 西南林业大学学报(自然科学)

ISSN: 2095-1914

年卷期: 2025 年 45 卷 006 期

页码: 98-107

摘要: 对1 554份大豆种质3年的瘪荚率(FPR)进行了鉴定,并利用全基因组关联分析(GWAS)对控制瘪荚的相关遗传位点进行了定位,探讨其发生规律及遗传基础。结果表明:环境(年份)、基因型及其相互作用对FPR均有显著影响。FPR范围为0.00%~70.30%,平均为4.30%,FPR<5.34%的大豆种质占75%,FPR<10%的占94.5%。最终筛选出6个FPR为0.00%的优异种质。利用方差分析方法,估计出FPR的广义遗传力为0.51。FPR与大豆的驯化和改良性状有关,地方品种的FPR通常低于改良品种。GWAS定位到6个与FPR相关的QTL位点,分布在5条染色体上。其中,第18号染色体上的qFPR-3位点可以用2种GWAS分析方法同时检测到。根据qFPR-3定位区间内基因的单倍型分析结果和基因注释信息,筛选出编码五肽重复(PPR)超家族蛋白的Glyma.18G085900基因作为qFPR-3位点的候选基因。

分类号: S565.1

  • 相关文献

[1]稻米蒸煮食味品质的全基因组关联分析及遗传解析. 林艳,林旻,陈在杰,顾建强,潘雷博,陈光伟,胡昌泉. 2024

[2]植物全基因组选择育种研究进展与前景. 郭亮虎,逯腊虎,张婷,史晓芳,袁凯,王镇,杨三维. 2015

[3]菠菜雌雄同株性状的全基因组关联分析. 汪豪英,刘志远,王晓武,武剑,张合龙,夏志兰,徐兆生,钱伟. 2019

[4]利用SLAF-seq结合BSA方法发掘大豆种皮色相关基因. 郁晓敏,金杭霞,杨清华,傅旭军,郭丹丹,吕晓男,袁凤杰. 2021

[5]大豆抗豆卷叶螟的转录组和蛋白质组关联分析. 孙祖东,赖振光,蔡昭艳,陈怀珠,杨守臻,唐向民. 2018

[6]东北春大豆花荚脱落性状与SSR标记的关联分析. 王欢. 2014

[7]大豆种质资源耐疫霉根腐病优异等位变异挖掘. 赵雪,孙明明,韩英鹏,李修平,张洪建,滕卫丽,李文滨. 2014

[8]利用关联分析方法挖掘自然群体中大豆油分和蛋白质含量相关SSR标记. 于志远,王伟威,魏崃,陈庆山,赵贵兴,齐照明,李杰,刘丽君. 2015

[9]大豆对胞囊线虫病3号和4号生理小种抗性遗传基础解析. 韩英鹏,赵雪,曹广禄,王艳,李英慧,刘东源,滕卫丽,张志武,李冬梅,邱丽娟,郑宏坤,李文滨. 2015

[10]华南大豆重要农艺性状与SSR的关联分析. 王梓钰,年海,宋恩亮,杨春明,王新风,马巍,富健. 2015

[11]大豆种质资源叶型和荚粒性状的关系及与SSR标记的关联分析. 伍宝朵,陈海峰,郭丹丹,沙爱华,单志慧,张晓娟,杨中路,邱德珍,陈水莲,朱晓玲,张婵娟,周蓉,周新安. 2012

[12]川渝地区地方和育成大豆品种籽粒性状关联分析. 杨红燕,何庆元,张英虎,杨华伟,向仕华. 2021

[13]应用关联分析鉴定大豆对腐霉菌的抗性基因. 魏崃,薛永国,王伟威,刘丽君,李文滨,喻德跃,南迪,梁会欣,楼兵干. 2013

[14]饲用大豆全株蛋白含量关联SSR标记筛选. 李忠旺,陈光荣,刘新星,杨如萍,朱天地,陈琛,陈子萱,陈玉梁. 2023

[15]微生物全基因组范围内的最小基因组研究进展. 刘晓艳,闵勇,张薇,王开梅,万中义,江爱兵,张光阳,程贤亮,杨自文. 2013

[16]企鹅源禽1型副黏病毒基因组序列分析. 施少华,黄瑜,程龙飞,傅光华,陈红梅,陈珍,苏敬良. 2009

[17]国内新型基因2型牛病毒性腹泻病毒研究进展. 张倩,陶洁,张东,区炳明,林航,杨颖,张信军,朱礼倩,王建业,贺生中,孟婷,谢静,朱国强. 2017

[18]草菇全基因组框架图. 鲍大鹏,赵国屏,谭琦,王升跃,陈明杰,郑华军,张劲松,朱永强,汪虹,康慧,陈祥,林楠,冯爱萍. 2010

[19]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

[20]整合REV LTR的自然重组马立克氏病毒GX0101的全基因组序列分析. 周忠文,苏帅,崔宁,孙鹏,孙淑红,崔治中. 2017

作者其他论文 更多>>