大白猪和莱芜猪肌内脂肪组织circRNAs的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李嫒

作者： 李嫒;张秀秀;黄万龙;解领丽;苗向阳

作者机构：

关键词： circRNA;肌内脂肪;脂肪沉积;脂质代谢;猪

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2018 年 07 期

页码： 1343-1353

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在探索circRNAs在脂肪组织可能发挥的潜在作用,为了解circRNA调控脂肪沉积和脂代谢作用的机制奠定基础。本研究采用RNA-Seq和生物信息学方法鉴定大白和莱芜猪肌内脂肪组织中circRNAs的表达情况,运用miRanda和Targetscan对差异表达circRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO和KEGG富集分析。结果发现,181个差异表达circRNAs得到鉴定,其中,102个在莱芜猪肌内脂肪组织中上调表达,79个下调表达。并对具有较多miRNA结合位点的ssc_circ_0002807、ssc_circ_0009352靶基因进行了GO和KEGG富集分析,发现靶基因富集于胆固醇平衡和磷脂平衡等与脂代谢相关的生物学过程。通过qRT-PCR,验证了ssc_circ_0002807、ssc_circ_0005382、ssc_circ_0009172和ssc_circ_0004824,与测序结果一致。由此推断,ssc_circ_0002807与ssc_circ_0009352可能参与调控脂肪沉积和脂质代谢。

分类号： S828.2

  • 相关文献

[1]脂质代谢相关基因在非酒精性脂肪肝实验猪中的研究进展. 马胜伟,陈一帆,涂尾龙,蒋玮,朱丽慧,吴潇. 2023

[2]高低肌内脂肪猪背最长肌关键基因表达差异分析. 谭娅,李亮,雷宇航,黄志洋,赵春萍,张静,张正群,齐婧,朱砺,史开志. 2022

[3]利用RNA-seq技术筛选大白猪皮下和肌内脂肪组织差异表达基因. 黄万龙,张秀秀,李嫒,苗向阳. 2017

[4]畜禽肌内脂肪沉积的基因调控及其作用机制. 汪凯歌,闫俊书,宦海琳. 2024

[5]非编码RNA调控畜禽肌内脂肪沉积的研究进展. 齐婧,谭娅,王婧,张静,赵春萍,张正群,史开志. 2022

[6]谷氨酰胺对肉鸡生长性能、脂肪沉积和脂质代谢的影响. 马建爽,常文环,李阳,刘国华,蔡辉益. 2019

[7]L-肉碱灌胃对热应激大鼠机体脂质代谢的影响. 李洁蕾,杨培歌,冯跃进,刘吉茹,郝月,崔艳军,杨春合,顾宪红. 2015

[8]多浪羊与小尾寒羊皮下脂肪组织转录组分析. 刘天义,冯卉,Salsabeel Yousuf,解领丽,苗向阳. 2021

[9]河田鸡肌内脂肪沉积规律的研究. 李忠荣,刘景,叶鼎承,陈婉如. 2014

[10]gga-miR-30d-5p表达分析及其对鸡脂肪沉积的调控作用. 黄华云,李瑞瑞,张子晓,王钱保,黄正洋,李春苗,赵振华. 2023

[11]卵泡刺激素对鸡体脂代谢影响的研究. 李颖颖,赵桂苹,刘冉冉,郑麦青,陈继兰,汪芳杰,白皓,周伟,文杰. 2013

[12]通过普通转录组测序挖掘调控松辽黑猪脂肪沉积的关键lnc RNA及其靶基因. 刘怡冰,邢凯,敖红,翟丽维,张丰霞,余健,刘华涛,石咏,马骏,王楚端. 2021

[13]ssc-miR-486靶基因预测及生物信息学分析. 张秀秀,黄万龙,郭云涛,苗向阳. 2016

[14]猪甲状腺激素应答Spot14基因编码区多态性与猪产脂能力的关联性. 周倩倩,陈宏权,魏汉卿,秦婕,陈华. 2011

[15]猪SGK家族基因的生物信息学分析及其在猪脂肪组织和细胞中的表达. 陈川河,刘嘉莉,张立兰,赵莹,陶聪. 2022

[16]基于高通量转录组测序技术构建猪脂肪沉积的lncRNA和miRNA相关ceRNA调控网络. 刘怡冰,邢凯,敖红,翟丽维,刘华涛,赵卿尧,石咏,李航,马福平,王楚端. 2022

[17]猪脂肪沉积和胚胎附植期FTO基因的表达及碱基突变检测. 付言峰,李兰,Robert V.Knox,李碧侠,方晓敏,任守文. 2018

[18]猪Gli1基因的克隆、表达谱分析及脂肪组织特异性表达载体的构建. 林佳丽,沈良才,潘登科,张瑾. 2012

[19]猪蛋白酪氨酸磷酸酶-1B基因第7内含子多态性与猪脂肪沉积性状的关联性. 王丽霞,魏金涛,冉志平,钱运国,喻婷,熊远著. 2012

[20]猪脂肪沉积候选基因AOC3、PPARG1及SOD3 DNA甲基化差异研究. 张恬,张龙超,王立刚,王立贤. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序