猪德尔塔冠状病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 江珊

作者： 江珊;李富强;李秀丽;王利丽;郑丽;张莉;路超;鄢明华

作者机构： 天津市农业科学院畜牧兽医研究所;天津市畜牧兽医研究所

关键词： 猪德尔塔冠状病毒;M基因;TaqMan探针;荧光定量PCR

期刊名称： 动物医学进展

ISSN： 1007-5038

年卷期： 2019 年 010 期

页码： 10-17

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为建立一种快速、灵敏、准确的猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)分子检测方法,根据PDCoV M基因的保守序列设计并合成引物和探针,建立了PDCoV M基因TaqMan荧光定量PCR检测方法.结果表明,该方法标准曲线具有良好的线性关系,相关系数为0.998;敏感性好,最低可检测到10 copies/μL的PDCoV M基因标准品;特异性试验结果显示,该方法与猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪轮状病毒(PoRV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、猪细小病毒(PPV)及大肠埃希菌K88菌株均无交叉反应;重复性试验变异系数低于2%,表明重复性良好.对121份临床样本进行检测,阳性检出率为53.7%(65/121),随机选择10份阳性样品的扩增产物进行测序分析,进一步证实扩增产物中含有PDCoV.该方法具有敏感性高、特异性强、用时短和高通量等特点,适用于PDCoV的定量检测与分子流行病学调查,为PDCoV的准确定量及进一步研究奠定了基础.

分类号： S852.651

  • 相关文献

[1]猪流行性腹泻病毒荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 董世娟,石明明,朱于敏,于瑞嵩,张源淑,夏东,李震. 2015

[2]猪圆环病毒2型TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立. 郭慧娟,李秀丽,张国伟,鄢明华,李海花,李富强. 2014

[3]H146-like鹅嵌杯病毒TaqMan-MGB PCR检测方法的建立及应用. 郑敏,张世忠,王劭,谢开春,江丹丹,肖世峰,陈少莺,邓国华. 2020

[4]猪圆环病毒I型荧光定量PCR检测方法的建立. 张福良,朱道中,宋长绪. 2008

[5]猪戊型肝炎病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立. 闫蕾,涂亚斌,李海,张交儿,王刚,刘永刚,陈志宝,蔡雪辉. 2016

[6]口蹄疫病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立. 胡晓亮,姜骞,仇铮,郭东春,刘家森,林欢,刘培新,田进,李志杰,刘大飞,刘春国,曲娟娟,曲连东. 2014

[7]荧光定量PCR检测牛性别相关基因DAX1表达的标准质粒和标准曲线的构建. 徐超,杜卫华,王宗礼,余大为,王栋,郝海生,赵学明,朱化彬. 2010

[8]新疆棉花黄萎病株内生真菌荧光定量检测及时空动态分析. 史应武,楚敏,杨红梅,高雁,张涛,曾军,林青,李玉国,欧提库尔,娄恺,罗明. 2018

[9]猪繁殖与呼吸综合征病毒TaqMan荧光定量RT-PCR方法的建立与应用. 刘长龙,张建武,韦祖樟,袁世山. 2010

[10]TaqMan探针实时定量PCR检测肉中金黄色葡萄球菌的研究. 邵美丽,许岩,刘思国,赵燕丽,孔保华. 2013

[11]TaqMan探针实时定量PCR检测肉中单增李斯特菌的研究. 邵美丽,刘思国,赵燕丽,孔保华. 2012

[12]大鼠微小病毒和细小病毒双重荧光定量PCR检测方法建立. 孙竹筠,蔡骁垚,熊炜,陈懿斐,张泉,李泽君,魏晓锋,陈鸿军. 2017

[13]猫冠状病毒荧光定量PCR检测方法的建立. 陈秋阳,梁瑞英,梁琳,汤新明,秦彤,丁家波. 2024

[14]鉴别非洲猪瘟野毒株与基因缺失疫苗株的三重TaqMan探针荧光定量PCR检测方法的建立. 宋影影,刘英楠,刘建奇,谢振华,于婉琪,吕璐,钟秋萍,宋庆庆,陈鸿军. 2022

[15]同时检测多杀性巴氏杆菌及其荚膜A型的双重TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立与初步应用. 刘本金,郑亚婷,许腾林,姜骞,刘家森,康洪涛,田进,郭东春,曲连东. 2021

[16]猪圆环病毒2型荧光定量PCR检测方法的建立. 张福良,宋长绪,杨鸣琦,朱道中,蒋智勇,林志雄,刘燕玲,宋志军. 2006

[17]定量检测牛雌性发育候选基因FOXL2表达方法的建立. 徐超,杜卫华,赵家平,余大为,王栋,郝海生,李光玉,朱化彬. 2012

[18]鸡贫血病毒TaqMan探针荧光定量PCR检测方法的建立. 宋修庆,高宏雷,王晓艳,林欢,宇文延青,王永强,王笑梅. 2009

[19]鸭疫里默氏杆菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立. 万春和,程龙飞,邵周伍林,刘思国,黄瑜,张云. 2014

[20]应用TaqMan荧光定量PCR检测H3N8亚型马流感病毒. 戴伶俐,郭巍,李雪峰,黄文强,赵立平,阿依吐拉·肉孜,相文华. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序