基于DNA条形码的物种界定算法比较研究-以北京周边地区舟蛾科为例

文献类型： 中文期刊

第一作者： 金倩

作者： 金倩;武春生;陈芬;罗桂杰;蔡卫佳;刘旭;杨采青;郝梦迪;张爱兵

作者机构：

关键词： 舟蛾科;DNA条形码;物种界定;GMYC;ABGD;jMOTU

期刊名称： 应用昆虫学报

ISSN： 2095-1353

年卷期： 2017 年 54 卷 001 期

页码： 13-21

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]为了探究3种常用物种界定方法(iMOTU、ABGD、GMYC)的界定效果.[方法]本研究以中国北京周边地区10个采样点483个舟蛾科样品为例,利用线粒体细胞色素C氧化酶I亚基基因(Cytochrome c oxidasesubunit I gene,CO I或COX1,约650bp)的部分序列,进行3种物种界定算法(iMOTU、ABGD、GMYC)的实例比较研究.[结果]3种物种界定方法的鉴定效力存在差异,与形态学结果相比较,ABGD方法划分物种的准确率为100%,基于BEAST的GMYC模型结果与形态学结果一致,产生的置信区间(64~68)覆盖了形态学的结果(67o然而,基于d8tree/MPLtree的GMYC方法倾向于高估MOTUs,iMOTU方法倾向于低估物种数目.[结论]结果显示,ABGD方法和基于BEAST的GMYC模型方法对于本文研究对象舟蛾科能够较好地划分,可以对基于形态学的物种界定进行有效补充.

分类号： Q145

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[1]基于DNA条形码的物种界定算法比较研究——以北京周边地区舟蛾科为例. 金倩,武春生,陈芬,罗桂杰,蔡卫佳,刘旭,杨采青,郝梦迪,张爱兵. 2017

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