大叶藻EST-SSR标记开发及其在大叶藻群体遗传多样性研究中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘福利

作者： 刘福利;刘坤;王飞久;孙修涛;汪文俊;梁洲瑞;马兴宇

作者机构：

关键词： 大叶藻;EST;SSR;遗传多样性

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2013 年 34 卷 04 期

页码： 91-97

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究从NCBI的EST数据库中下载大叶藻EST序列共计10 659条,从中得到SSR位点共65个,SSR发生频率为1.7%,平均分布距离为21.7kb。其中三核苷酸为优势重复类型,占49.2%,二核苷酸数量仅次于三核苷酸,占33.8%。基于65条含有SSR的EST序列,设计并合成了30对引物,其中26对引物的扩增产物单一,片段大小与预测的相近或较大。在由16个大叶藻个体组成的群体中,其中8对引物的扩增条带具有多态性。利用这8对引物对青岛汇泉湾大叶藻自然群体进行了遗传多样性分析,结果表明,8个SSR共检测出33个等位基因,平均每个SSR能检测出4.1个等位基因,多个遗传多样性参数表明,青岛汇泉湾大叶藻群体具有较高的遗传多样性(Ho=0.5382;He=0.577 6;I=0.560 7)。本研究开发的EST-SSR标记,可进一步丰富大叶藻SSR标记信息,为大叶藻分子生态和群体遗传研究提供更多的标记选择。

分类号： S917.3

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