基于SNP标记的青海湖裸鲤遗传多样性及种群结构研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 罗慧

作者： 罗慧;方弟安;何苗;毛成诚;匡箴;祁洪芳;徐东坡

作者机构：

关键词： 青海湖裸鲤;单核苷酸多态性;基因分型技术;遗传分化;渔业资源

期刊名称： 南方水产科学

ISSN： 2095-0780

年卷期： 2023 年 001 期

页码： 86-96

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究青海湖裸鲤（Gymnocypris przewalskii）的种质资源现状，为该物种保护措施的制定提供参考依据。首次利用基因分型技术（Genotyping-by-sequencing, GBS），对青海湖水域的6个地理群体共72尾青海湖裸鲤进行单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism, SNP）标记开发和遗传特征分析。共检测出1 600 061个SNP位点，质控后筛选出45 266个高质量的SNP位点用于遗传分析，发现核苷酸多样性（Pi）为0.317 0～0.327 4，观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）分别为0.459 4～0.482 3和0.336 7～0.344 4。6个地理群体的遗传距离（D）为0.018 4～0.023 3，两两群体的遗传分化系数（Fst）均不显著（P＞0.05）。分子方差分析（Analysis of molecular variances, AMOVA）显示102.37%的遗传变异来自群体内；群体遗传结构和系统发育进化树分析均显示6个群体属于一个集群，具有遗传同质性；而主成分判别分析（Discriminant analysis of principal components, DAPC）表明哈尔盖河、黑马河和沙柳河群体相互交叉聚类，其余3个地理群体分别聚类。综上，6个青海湖裸鲤群体的Ho均大于He，种群结构单一。

分类号： S917.4

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