副猪嗜血杆菌sapA基因克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭海祥

作者： 郭海祥;李艳;郭怡德;宋帅;勾红潮;臧莹安;李春玲

作者机构：

关键词： 副猪嗜血杆菌;sapA基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2021 年 008 期

页码： 2754-2761

收录情况： 北大核心

摘要： 试验旨在克隆副猪嗜血杆菌（Haemophilus parasuis, Hps）sapA基因,并对其进行生物信息学分析,以期为sapA基因缺失疫苗的开发与应用提供理论依据。以71株临床菌株为研究对象,经PCR扩增鉴定其中的阳性菌株;将扩增得到的sapA基因片段与pGEM-T载体连接,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,经PCR和双酶切鉴定为阳性克隆后进行测序;用生物信息学软件进行核苷酸与氨基酸序列比对、系统进化树分析、蛋白二级和三级结构预测、疏水性预测、柔性区域位预测、B细胞抗原表位预测和Jameson-Wolf抗原指数预测。试验结果显示,在71株临床菌株中,有29株成功扩增出sapA基因,29株Hps的sapA基因核苷酸序列与已公布的SH0165菌株相似性为96.5%～98.8%,除H88菌株外,氨基酸序列与SH0165菌株相似性为98.9%～100%。sapA蛋白二级结构主要有α-螺旋、β-转角和无规则卷曲,有13个亲水区、38个柔性区和23个B细胞潜在抗原表位。以上结果表明,Hps的sapA基因是一个保守基因,各菌株间核苷酸序列、氨基酸序列都有很高的相似性,sapA蛋白具有较强的抗原性。

分类号： S852.61

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