辽宁省沈阳市猫泛白细胞减少症病毒VP2、NS1基因的遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘琪

作者： 刘琪;刘正伟;张利;王超;郝春晖;高锋;姜仁礼;梁琳;田长永

作者机构：

关键词： 猫泛白细胞减少症病毒;VP2基因;NS1基因;基因突变;遗传进化分析

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2025 年 006 期

页码： 81-87

收录情况： 北大核心

摘要： 为了解辽宁沈阳地区猫泛白细胞减少症病毒(Feline panleukopenia virus, FPV)VP2和NS1基因的遗传变异情况，试验从辽宁省沈阳市3个动物医院和1个猫繁育场收集疑似FPV感染的猫粪便拭子样本13份(编号为FPV-8～FPV-20),利用胶体金试纸条进行FPV检测，提取阳性样本中的病毒DNA后进行VP2和NS1基因的PCR扩增、测序、同源性分析、编码蛋白的氨基酸突变位点分析及遗传进化树构建。结果表明：13份样本均呈FPV阳性，经PCR扩增均得到大小为1 755 bp的VP2基因和大小为2 007 bp的NS1基因。13份样本中的FPV VP2基因之间的核苷酸相似性为98.7%～100%,与GenBank中FPV参考毒株的核苷酸相似性为98.6%～100%,其中FPV-LN15、FPV-LN18、FPV-LN19与BJ540(MT270553.1)、FPV ZJFPV15(MW495840.1)和FPV-SH2003(MW811187.1)的核苷酸相似性为100%;13份样本中的FPV NS1基因之间的核苷酸相似性为99.0～100%,与GenBank中FPV参考毒株的核苷酸相似性为99.1%～99.9%,其中FPV-LN8、FPV-LN10和PPV-LN13的核苷酸相似性为100%,FPV-LN9、FPV-LN18和FPV-LN19的核苷酸相似性为100%,PPV-LN15和FPV-LN17的核苷酸相似性为100%。13份样本中的FPV VP2蛋白共存在5个氨基酸突变位点(第91,301,302,305,307位),FPV NS1蛋白共存在6个氨基酸突变位点(第17,23,60,247,443,596位)。基于VP2基因构建的遗传进化树中共分为2个大分支，FPV和水貂肠炎病毒(Mink enteritis virus, MEV)毒株聚为一支，犬细小病毒(Canine parvovirus, CPV)毒株处于一个独立分支。样本FPV-LN11、FPV-LN13、FPV-LN8、FPV-LN16、FPV-LN10、FPV-LN20处于一个较小分支，样本FPV-LN14处于独立小分支，且与FPV HNZZ2株(MZ005633.1,郑州)、FPV Barut株(MZ391096.1,土耳其)、FPV 17D01株(OP153925.1,韩国)、FPV DLC02株(MN418998.1,大连)处于不同小分支；样本FPV-LN9、FPV-LN12、FPV-LN15、FPV-LN18、FPV-LN19与FPV JSNJ-21G5株(OP796709.1,扬州)、FPV BJ540株(MT270553.1,北京)、FPV-SH2003株(MW811187.1,上海)、FPV ZJFPV15株(MW495840.1,扬州)处于一个较小分支，样本FPV-LN17处于独立小分支，且与FPV＿ARG08(FJ440714.1)株(阿根廷)处于不同小分支。基于NS1基因构建的遗传进化树共分为两个大分支，FPV毒株和CPV毒株分别为两个独立的分支，FPV-LN9、FPV-LN12、FPV-LN15、FPV-LN17、FPV-LN14、FPV-LN18、FPV-LN19与FPV-SH2003株(MW811187.1,上海)和FPV-SH2001株(MW650831.1,上海)处于一个较小分支，FPV-LN8、FPV-LN11、FPV-LN13、FPV-LN10、FPV-LN16、FPV-LN20株与FPV HNZZ2株(MZ005633.1,郑州)处于一个较小分支，均与FPV＿IZSSI＿42807＿15株(KX434462.1,意大利)、FPV株(X55115.1,澳大利亚)处于不同小分支。说明各样本两种基因的亲缘关系基本一致(除样本FPV-LN14外),FPV毒株在同一地理范围内具有较高的遗传相似性。

分类号： S852.65

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