基于叶绿体DNA 序列的Ceratotropis 亚属遗传进化研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘岩

作者： 刘岩;程须珍;王丽侠;王素华;白鹏

作者机构：

关键词： Ceratotropis 亚属;叶绿体DNA;序列差异;遗传进化

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2013 年 39 卷 6 期

页码： 979-991

收录情况： CSCD

摘要： 作为Ceratotropis 亚属起源中心之一, 中国有丰富的Ceratotropis 亚属种质资源, 但种间遗传进化研究相对落后。为探索该亚属各种间的亲缘关系及遗传演化规律, 对Ceratotropis 亚属18个种及亚种共110份材料的叶绿体基因组2个内含子(rpl16、rps16)和3个基因(psbA-trnH、rpoB-trnC 和trnL-trnF)的间隔区序列进行了研究。结果表明, 各序列的信息位点百分率在3.63%~24.28%之间, 其中rps16最高, rpoB-trnC 最低。序列拼接的Kimura 进化距离分析发现, 各种间进化距离介于0~0.057之间, V. minima 复合体(V. minima、V. riukinensis 和V. nakashime)和V. subramaniana 的进化距离最大。基于单个序列, 利用MEGA5.1和PAUP4.0软件构建的邻接树和最大简约树的结果均将Ceratotropis 亚属18个种及亚种划分为2个大支, 其中第I 类包含9个种和亚种, 为3个组(Angulares、 Ceratotropis 和Aconitifoliae)的混合体, 第II 类也包含9个种和亚种, 全部属于Angulares 组。系统发育树的分化同质性检验表明其拓扑一致性较高(P=0.87)。psbA-trnH 等5个序列的分子系统进化研究对阐明Ceratotropis 亚属种间亲缘关系和系统演化具有重要的理论和现实意义。

分类号：

  • 相关文献

[1]基于叶绿体DNA序列的Ceratotropis亚属遗传进化研究. 刘岩,程须珍,王丽侠,王素华,白鹏. 2013

[2]一种鉴定菜用枸杞的新方法-NRDNA ITS测序法. 石志刚,安巍,焦恩宁,赵建华,王亚军. 2008

[3]ω-3脂肪酸脱氢酶在高、低油大豆品种中的克隆与序列分析. 刘文浩,李伟,陈相艳,戴海英,张礼凤. 2008

[4]中国鹿亚科动物mtDNA控制区序列差异及其遗传分化(英文). 涂剑锋,邢秀梅,徐佳萍,杨颖,杨福合. 2011

[5]中国鹿亚科动物mtDNA控制区序列差异及其遗传分化(英文). 涂剑锋,邢秀梅,徐佳萍,杨颖,杨福合. 2011

[6]羊与麝朊蛋白基因的序列差异. 陈豪泰,张杰,刘永生,吴润. 2006

[7]鸡艾美耳属球虫18SrDNA遗传与变异分析. 贾万忠,闫鸿斌,才学鹏,田广孚. 2007

[8]中国鹿亚科动物mtDNA控制区序列差异及其遗传分化. 涂剑锋,邢秀梅,徐佳萍,杨颖,杨福合. 2012

[9]南海金线鱼属Nemipterus鱼类COⅠ和Cytb基因片段的比较分析. 董丽娜,黄梓荣,李永振,陈国宝. 2012

[10]OPA套式PCR诊断方法的建立. 罗军荣,周艳喜,高华,周建华,马学恩. 2009

[11]水稻粒长基因GS3和qGL3功能标记的设计及应用. 张亚东,郑佳,赵春芳,陈涛,赵庆勇,朱镇,周丽慧,姚姝,赵凌,于新,王才林. 2014

[12]应用SYBR-GreenⅠ实时荧光PCR鉴别TTV1、TTV2方法的建立. 陈欣,符芳,王伟,李雪松,李海忠,宋淑萍,李曦. 2010

[13]桃叶绿体全序列微卫星分布规律研究. 魏潇,章秋平,刘威生,杨巍. 2013

[14]分子生物技术在确定物种迁移后遗传变异中的应用. 沈禹颖,侯扶江. 2002

[15]茶树叶绿体DNA提取方法研究. 陈春梅,陈亮. 2014

[16]中国栽培稻及其近缘野生种叶绿体DNA的限制性片段长度. 肖晗,应存山,黄大年. 1996

[17]雷蒙德氏棉叶绿体基因组Fosmid文库构建. 李朋波,薛龙飞,王彦霞,张曦,李召虎,华金平. 2011

[18]苜蓿组培中叶绿体DNA和线粒体DNA的变异. 何启谦,刘新芝. 1994

[19]甘蔗叶绿体DNA的提取方法及其验证分析. 黄玉新,罗霆,周珊,高轶静,段维兴,杨翠芳,周会,张革民. 2014

[20]江淮流域杂草稻叶绿体DNA的籼粳分化. 杨杰,王军,曹卿,陈志德,汤陵华,王艳萍,方先文,王才林,仲维功. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序