娄门鸭胸肌性状相关指标的全基因组关联分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘宏祥
作者: 刘宏祥;沈永杰;张丽华;周腾彬;刘小倩;章双杰;朱春红;朱静;陈晓颖;黄学成;宋卫涛;陶志云;王志成;徐文娟;李慧芳
作者机构:
关键词: 鸭;胸肌;全基因组关联分析;单核苷酸多态性
期刊名称: 中国家禽
ISSN: 1004-6364
年卷期: 2024 年 46 卷 004 期
页码: 8-14
收录情况: 北大核心
摘要: 为寻找与鸭胸肌性状相关的候选基因,鉴定鸭胸肌性状相关分子标记,试验以199只娄门鸭为试验材料,采集血液提取DNA,用基因组重测序方法进行基因分型,利用PLINK 1.90对分型结果进行质控后,采用rMVP软件中的FarmCPU模型对SNPs(Single nucleo-tide polymorphisims)与胸宽、胸深、胸肌重和胸肌率4个性状指标做GWAS分析,定位出显著位点.结果显示:与胸宽相关的SNPs位点有4个,位于1、11、18号染色体上;与胸肌重相关的SNPs位点有2个,位于2、3号染色体上;与胸肌率相关的SNPs位点有2个,位于2号染色体上.通过基因功能注释,这些位点对应的胸肌性状候选基因有 8个,分别是LOC119715526、RLBP1、ABHD2、KYAT1、SPOUT1、LOC101800569、EVA1A和NOL4.研究表明,在不同染色体上共鉴定到8个与胸肌性状显著相关的SNPs位点,这些位点共涉及8个候选基因.
分类号: S834.2
- 相关文献
[1]鸭胸肌矿物元素含量全基因组关联分析. 余大新,刘文静,刘大鹏,刘同,张鹤,盖凯,李姝楠,张贝贝,侯水生,周正奎. 2023
[2]高邮鸭和金定鸭胸肌早期发育及MyoD1基因表达分析. 朱春红,陶志云,宋迟,宋卫涛,胡艳,束婧婷,章双杰,李慧芳. 2013
[3]鸭胚胎发育后期胸肌萎缩相关通路及基因鉴定. 刘宏祥,朱春红,宋卫涛,陶志云,徐文娟,章双杰,王志成,李慧芳. 2023
[4]鸭颈胸椎数目变异与其相关性状遗传参数估计. 徐垭烯,胡健,刘贺贺,周正奎,侯水生,刘小林. 2019
[5]羊重要性状全基因组关联分析研究进展. 张统雨,朱才业,杜立新,赵福平. 2017
[6]基于简化基因组测序的红罗非鱼低温体色变异全基因组关联分析. 徐鸿飞,陈诏,黄彩林,袁宗伟,赵何勇,李华,杨宾兰,周大颜,苏换换,朱华平. 2021
[7]棉籽大小数量性状核苷酸定位及候选基因初步筛选. 乔丹,白冰楠,葛群,刘小芳,栾玉娟,牛皓,龚举武,巩万奎,闫浩亮,李俊文,刘爱英,石玉真,Elsamman Elameer,陈全家,袁有禄. 2024
[8]全基因组关联分析在5种农作物中的应用及展望. 王乐,于茗兰,陈强,柳雨汐,郑晓明,逄洪波. 2024
[9]烤烟烟碱含量的全基因组关联分析. 孙鑫,文柳璎,尹鹏嘉,罗成刚,樊文强,任民. 2017
[10]基于单倍型肉牛屠宰性状全基因组关联分析研究. 李宏伟,徐凌洋,王泽昭,蔡文涛,朱波,陈燕,高雪,张路培,高会江,李俊雅. 2022
[11]利用混合线性模型和BayesCPi进行QTL-MAS2011公共数据集的全基因组关联分析. 朱波,吴洋,齐欣,牛红,张静静,王延晖,陈燕,张路培,高会江. 2014
[12]肉鸡屠宰性状全基因组关联分析. 王一东,陈智武,黄超,粟永春,余洋,崔焕先,郑麦青,赵桂苹,文杰,王述柏. 2024
[13]茶树新梢中香叶醇樱草糖苷含量的全基因组关联分析. 王让剑,杨军,张力岚,高香凤. 2023
[14]黄瓜核心种质白粉病抗性的全基因组关联分析. 贾会霞,李锡香,宋江萍,林毓娥,张晓辉,邱杨,阳文龙,娄群峰,王海平. 2021
[15]鸭胸肌肉色性状全基因组关联分析. 刘大鹏,凡文磊,唐静,周正奎,侯水生. 2020
[16]鸭胸肌肌内脂肪含量全基因组关联分析. 刘文静,凡文磊,刘大鹏,赵金山,周正奎,侯水生. 2021
[17]高邮鸭群体MSTN、MyoD1和MyoG基因外显子中SNP位点的分析. 刘宏祥,徐文娟,宋卫涛,朱文奇,胡艳,姬改革,李慧芳. 2015
[18]鸭前胰岛素原基因的单核苷酸多态性研究. 朱文奇,陈文峰,宋卫涛,宋迟,胡艳,李慧芳,王金玉. 2014
[19]鸭催乳素基因内含子1单核苷酸多态性分析. 杨恒东,宋卫涛,朱文奇,徐文娟,李慧芳,陈宽维. 2010
[20]鸭不同品种特异性分子标记SNP的筛选与鉴定. 朱涛,谷洪昌,张泽宾,陈余,贾亚雄,吕学泽,王梁,曲鲁江. 2018
作者其他论文 更多>>
-
一株群体感应抑制活性链霉菌的筛选鉴定及其毒力因子代谢能力分析
作者:柏晓玉;朱丽英;包慧芳;江凌;朱静;顾美英;朱艳蕾;张志东
关键词:群体感应抑制剂;干旱地区放线菌;欧文氏菌;毒力因子
-
江苏省商品蛋鸭生产现状调查与分析
作者:张丹;梁忠;戴有礼;刘向萍;顾华兵;王晓峰;张静;朱静;李婷婷;段炼;李新
关键词:蛋鸭;生产现状;饲养方式;江苏
-
SNPs分子标记在地方品种鸭鉴定中的应用
作者:朱春红;刘宏祥;王志成;徐文娟;宋卫涛;陶志云;章双杰;李慧芳
关键词:地方鸭品种;分子标记;SNPs;品种鉴定
-
玉米果穗湿储技术与装备分析
作者:张丽华;李谦;张峰;籍俊杰
关键词:玉米果穗;湿储技术;装备
-
我国家禽产业发展历程、现状、面临挑战及建议
作者:朱静;李婷婷;施寿荣;李蕾蕾;宋真;刘向萍
关键词:家禽业;品种;养殖规模;成就;对策
-
我国鸽、鹌鹑及特种家禽产业发展现状、存在问题及对策
作者:朱静;李婷婷;施寿荣;谢鹏;刘向萍
关键词:特种家禽;鸽;鹌鹑;种业;饲养品种;养殖模式
-
河北山前平原夏玉米绿色高效生产技术
作者:翟立超;张丽华;贾秀领
关键词:夏玉米;机械化;绿色高效生产技术