绒毛状烟草基因组中SSR位点的信息分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王卫锋

作者： 王卫锋;晁江涛;龚达平;王鲁;李凤霞;陈雅琼;孙玉合

作者机构：

关键词： 绒毛状烟草;简单重复序列;基元

期刊名称： 中国烟草科学

ISSN： 1007-5119

年卷期： 2011 年 32 卷 03 期

页码： 32-35+40

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过SSRFINDER软件搜索绒毛状烟草基因组DNA,设置条件是重复单元长度2~5 bp,重复次数10～60,共找到6 441个SSR位点,涉及5 227个Scaffold,SSR序列总长为303 963 bp,约占全基因组的0.12‰,即绒毛状烟草基因组中平均每400 kb会出现一个SSR位点。在所有SSR位点中,二、三碱基重复基元分别占总数的45.2%和49.6%,重复单元的重复次数10～20之间的SSR位点占总数的74.6%。

分类号： TS413

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