烟草C2H2锌指蛋白转录因子家族成员的鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨明磊

作者： 杨明磊;晁江涛;王大伟;胡军华;吴华;龚达平;刘贯山

作者机构：

关键词： C2H2锌指蛋白转录因子;烟草;基因家族

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2016 年 38 卷 04 期

页码： 337-349

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： C2H2锌指蛋白转录因子家族在真核生物中具有重要的生物学功能,广泛参与植物叶的发生、花器官的调控、侧枝的形成及逆境胁迫等生命过程。植物C2H2锌指蛋白不仅结合DNA和RNA,而且与蛋白质之间相互作用。本研究利用普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组数据库,运用Blastp比对,结合Pfam和SMART分析,鉴定了118条普通烟草C2H2锌指蛋白家族成员;对烟草C2H2锌指蛋白家族进行了进化树分析、结构域分析、物理化学性质分析、染色体定位、基因结构分析、三维结构分析及组织表达分析等。结果表明:不同成员的氨基酸长度差异较大;系统进化及结构域分析显示,所有C2H2家族成员可以被分为5个亚家族,同一亚家族成员之间在结构域和理化性质上呈现较高一致性;每个成员都含有C2H2结构域,在数量上存在较大差异;将所有基因家族成员定位在22条染色体上;组织表达分析表明,每个C2H2亚家族都有成员在不同组织中表达,在叶及根中有些基因的表达量较高。

分类号： Q943.2

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