DNA条形码序列对不同品种美国山核桃的鉴定
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈亚辉
作者: 陈亚辉;朱海军;生静雅;张普娟;鲍瑾;刘广勤
作者机构:
关键词: DNA条形码;美国山核桃;品种鉴定
期刊名称: 江苏农业学报
ISSN: 1000-4440
年卷期: 2013 年 29 卷 06 期
页码: 1445-1450
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 选择ITS、ITS2、psbA-trnH、matK 4条序列进行评价,以扩增及测序成功率、变异位点数和k-2-p距离等指标评价各序列的鉴定能力。此外,基于MEGA5分析不同品种美国山核桃序列种间K2P遗传距离并构建NJ树。结果显示:不同品种美国山核桃4条序列的扩增及测序成功率扩增均为100%。不同品种的ITS2和psbA-trnH序列一致性为100%,而ITS和matK序列的一致性分别为99.32%和99.95%,两者均存在较多的变异位点,可以有效地区分美国山核桃不同品种。因此,ITS和matK序列可以作为鉴定美国山核桃不同品种的优势条形码组合。
分类号: S664.1
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