文献类型： 中文期刊
第一作者： 王晶晶
作者： 王晶晶;李旭鹏;薛倩;曹宝祥;栾生;罗坤;隋娟;代平;曹家旺;谭建;陈宝龙;傅强;孔杰;高焕;孟宪红
作者机构：
关键词： 凡纳滨对虾;白斑综合征病毒（WSSV）;TRAP;表达水平;SNP;DNA甲基化
期刊名称： 中国水产科学
ISSN： 1005-8737
年卷期： 2024 年 001 期
页码： 1-13
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 本研究旨在探讨凡纳滨对虾（Litopenaeusvannamei）易位子相关蛋白α亚基（translocon-associatedproteinalpha,TRAPα）基因特征及其在抗白斑综合征病毒（white spot syndrome, WSSV）中的作用。通过PCR和Sanger测序技术,获得凡纳滨对虾TRAPα的开放阅读框（openreadingframe,ORF）序列,将该基因命名为Lv-trapα,并进行生物信息学分析。采用real-time PCR分析Lv-trapα基因在健康凡纳滨对虾和感染WSSV不同时间点的凡纳滨对虾肝胰腺、鳃、肌肉、眼柄中的Lv-trapα表达水平。同时,利用重亚硫酸氢盐测序技术（bisulfite sequencing PCR, BSP）检测健康凡纳滨对虾和感染WSSV后96 h的凡纳滨对虾肝胰腺组织中Lv-trapα基因上游DNA序列的甲基化水平。结果显示,Lv-trapα的ORF全长873 bp,共编码290个氨基酸,预测相对分子质量为32466.4,理论等电点为4.45。多序列比对发现TRAPα蛋白的保守性较高。Lv-trapα DNA序列中有8个单核苷酸多态性位点（single nucleotide polymorphism,SNP）,其中1个SNP位点处于外显子区域且属于错义突变,其余7个SNP位点处于内含子区域。real-time PCR结果显示, Lv-trapα基因在凡纳滨对虾肝胰腺、鳃、肌肉、眼柄中均有表达,且在感染WSSV后显著上调表达（P＜0.05）。值得注意的是,在感染WSSV后96 h,体内病毒含量不同的凡纳滨对虾肝胰腺中Lv-trapα的表达水平差异显著,高病毒含量组中Lv-trapα的表达水平显著高于低病毒含量组（P＜0.05）,提示Lv-trapα表达水平和WSSV复制水平存在正相关性。BSP结果显示,Lv-trapα基因上游1个CpG位点（存在于NCBI数据库NW＿020872863.1第360336-360337 nt位置）的甲基化水平和Lv-trapα表达水平呈负相关,该CpG位点的甲基化水平和凡纳滨对虾体内WSSV病毒含量也呈负相关。本研究可为深入研究凡纳滨对虾抗WSSV的分子机制和抗病分子育种提供理论参考。
分类号： S917.4
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