油菜抗菌肽基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 柯涛

作者： 柯涛;毛晗;董彩华;郭学兰;黄思良;刘胜毅

作者机构：

关键词： 油菜;抗菌肽;生物信息学

期刊名称： 基因开启未来：新时代的遗传学与科技进步——湖北省遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编

ISSN：

年卷期： 2009 年

页码： 1

收录情况： CSCD

摘要： 本研究利用生物信息学方法对油菜ESTs(expressedsequencetags,ESTs)数据库中596,361条EST序列进行了分析。经过对EST序列的预处理、拼接和对抗菌肽数据库比对,我们已经初步鉴定了油菜中近1000条与抗菌肽基因同源的候选基因,这些基因与25类不同来源的抗菌肽基因同源。通过对这些油菜候选基因功能注释的结果,发现它们来源丰富,分属于核糖体蛋白,几丁质酶,果胶酸裂解酶,半胱氨酸蛋白酶,果胶酯酶家族,蛋白酶抑制剂,PR4家族蛋白,histoneh2a,uv诱导蛋白,赤霉素诱导蛋白,硫素,转脂蛋白,植物防御素家族蛋白,具蛋白脂质微粒体(Saposin)B结构域样蛋白,类...

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