亚麻响应低钾胁迫转录谱分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄文功

作者： 黄文功;姜卫东;姚玉波;宋喜霞;刘岩;陈思;赵东升;吴广文;袁红梅;任传英;孙中义;吴建忠;康庆华

作者机构：

关键词： 亚麻;低钾;转录组;差异表达基因

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 1070-1081

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 钾是亚麻生长发育必需的大量元素。本研究以钾高效利用亚麻品种Sofie为试验材料,在低钾处理12h和96h下,利用转录组测序及qRT-PCR进行低钾胁迫下差异基因表达调控的研究。结果表明,低钾处理7d的亚麻叶片边缘变黄,与对照相比,低钾处理植株矮化。筛选出对低钾响应强烈的3个钾运转蛋白基因LusKC1 （Lus K channel1）、LusSKOR （Lus STELAR K+outward rectifier）和LusHAK5 （Lus high affinity K+transporter 5）,低钾胁迫响应峰值时间为12 h和96 h;与对照相比,低钾处理12 h鉴定到差异表达基因1154个（508个上调, 646个下调）, GO功能富集分析表明,这些差异表达基因主要富集于代谢过程、细胞进程、单一生物过程、催化活性和结合功能五大类, KEGG通路富集分析表明,这些差异表达基因涉及到能量代谢、碳水化合物代谢、碳代谢、氨基酸代谢、萜类化合物代谢和植物激素信号转导等通路。进而筛选出7个与钾直接相关基因（4个钾运输蛋白、2个钾通道蛋白及1个钠钾钙交换蛋白）、13个与激素相关基因以及6个与纤维素合成相关基因。7个与钾直接相关基因中,2个基因表达量上调1.75倍和2.64倍,5个基因表达量下调1.21～9.57倍。以上解析的差异基因初步揭示了亚麻低钾涉及的转录调控途径,可为亚麻耐低钾相关基因的克隆与功能验证奠定基础。

分类号： S563.2

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