'金如意'山楂叶绿体基因组特征与系统进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 林冉冉

作者： 林冉冉;王宏伟;焦慧君;董肖昌;关秋竹;魏树伟;聂宗省;张玮玮;冉昆

作者机构：

关键词： ‘金如意’山楂;叶绿体基因组;系统进化分析

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2025 年 57 卷 008 期

页码： 24-34

摘要： 本研究以‘金如意’山楂叶片为材料，利用Illumina高通量测序技术对其叶绿体基因组进行测序，对序列进行组装和分析，并对34种蔷薇科植物的叶绿体基因组进行系统进化分析。结果表明，‘金如意’山楂叶绿体基因组全长159 655 bp, GC含量36.65%,包含一个87 748 bp的大单拷贝(LSC)区、一个19 139 bp的小单拷贝(SSC)区和一对26 384 bp的反向重复(IR)区；共编码130个基因，包括85个蛋白编码基因、37个tRNA基因和8个rRNA基因；共检测到264个SSR位点和57个重复序列，其中SSR位点大部分由A和T重复碱基组成；高频密码子(RSCU>1)有31个，其中以A/U结尾的有29个；与其他蔷薇科植物相比，‘金如意’山楂叶绿体基因组IR区边界相对保守。系统进化分析表明，‘金如意’山楂与大果山楂(Crataegus pinnatifida var. major)亲缘关系最近，属于大果山楂类型。研究结果可为山楂种质资源鉴定、遗传多样性研究和资源开发利用奠定基础。

分类号： S661.5

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