甜瓜GATA基因家族的鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 侯银鹤

作者： 侯银鹤;张永平;姚东伟;刁倩楠;田守波;乔宏宇;曹燕燕

作者机构：

关键词： 甜瓜;GATA转录因子;基因家族;表达模式;胁迫响应;白粉病

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2025 年 53 卷 004 期

页码： 31-40

收录情况： 北大核心

摘要： GATA转录因子是一类广泛存在于真核生物中具有Ⅳ型锌指结构域的转录因子，在植物生长和发育过程中起重要作用。GATA基因家族已在各种植物中被发现，但是目前尚无甜瓜GATA转录因子的报道。为此，利用生物信息学对甜瓜GATA家族基因成员进行了全基因组鉴定与分析。结果表明，甜瓜基因组中共鉴定到25个GATA基因，这些基因不均匀地分布在10条染色体上。25个GATA基因编码的氨基酸长度在131～565 aa之间，蛋白分子量在14.13～63.04 ku之间，等电点范围介于3.63～9.71之间，80%定位在细胞核。根据进化关系可将甜瓜GATA家族分为3个亚族，分别包含了6、8、11个成员。启动子分析发现，GATA基因家族上游存在大量与植物激素、光信号和逆境相关的顺式作用元件，显示可能存在多种转录调控。基因组织表达模式分析结果表明，约50%GATA家族成员在甜瓜不同组织中呈不同程度的特异性表达。采用qRT-PCR方法对白粉病菌胁迫下的6个甜瓜GATA基因的表达水平进行分析，结果表明GATA基因家族可能参与甜瓜对白粉病菌侵染的响应。

分类号： S652

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