基于基因组学的小海绵羊肚菌环境适应研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李艳艳
作者: 李艳艳;徐鸿雁;谢占玲;孟清
作者机构: 青海大学;青海省农林科学院
关键词: 小海绵羊肚菌;环境适应相关基因;胁迫;基因组分析
期刊名称: 青海农林科技
ISSN: 1004-9967
年卷期: 2024 年 003 期
页码: 8-16
摘要: 本研究基于小海绵羊肚菌M12-10基因组数据库挖掘环境适应基因,探索其在高原极端环境中的适应机制。结果显示,通过KEGG注释数据库筛选出83条环境适应基因,主要涉及MAPK信号通路(60条)、磷脂酰肌醇信号系统(16条)和ABC转运蛋白类(7条)。通过BLAST和文献综述将这些基因分为低温、紫外、盐等8类环境因素相关因子,其中抗逆境胁迫基因最多,为44条,抗低氧胁迫基因最少,为4条。筛选的盐基因M12-10_G01390在1 mol/L低盐浓度胁迫下表达量最低,3 mol/L高盐浓度胁迫下时表达量相对较高(0.25);低温基因M12-10_G03567在4℃胁迫下表达量最高(1.9);紫外基因M12-10_G04909在短时间(30 min)紫外照射下表达量升高(1.34),在中长(60 min、120 min)、长时间(300 min)紫外照射下,其表达量下降(均在0.25以下)。本文为后续的羊肚菌在青藏高原生态环境中适应性研究提供参考。
分类号: S646.7
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