非优异SSR原因分析及解决方案
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘文彬
作者: 刘文彬;许理文;冯博;易红梅;任洁;田红丽;赵涵;吕远大;蔚荣海;赵久然;王凤格
作者机构:
关键词: 优异SSR;非特异峰;N+1峰;测序;重新设计
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2017 年 11 期
页码: 4547-4555
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: SSR标记在真实性检测、纯度鉴定、以及指纹库构建中起着至关重要的作用。在其筛选过程中会遇到许多具有N+1峰等异常峰型、非特异性峰、多态性低、不适于软件自动分析等非优异SSR引物。为了解并掌握非优异SSR引物表现以及形成原因,本研究以22份初筛材料、27套三联体材料及95份自交系对新型SSR引物进行评估筛选,从中选取有代表性的11对SSR引物,现在已对10种非优异SSR引物表现进行描述,分析形成原因,通过测序对一对引物进行重新设计,并获得较好效果。
分类号: Q943.2
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