苜蓿属不同物种叶绿体基因组结构比较及亲缘关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田春育

作者： 田春育;李志勇;刘倩;于林清;武自念

作者机构：

关键词： 苜蓿属;叶绿体全基因组;结构变异;系统发育

期刊名称： 中国草地学报

ISSN： 1673-5021

年卷期： 2021 年 010 期

页码： 1-8

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以苜蓿属24个种1个亚种叶绿体基因组为研究对象,利用REPuter、mVISTA和MAFFT等分析叶绿体基因组的重复序列、序列变异情况及进化关系。结果表明,苜蓿属不同种间叶绿体基因组介于121313～132269bp之间,编码110～118个基因,基因数目的差异主要是因蛋白编码基因数目不一所致。在苜蓿叶绿体基因组中共检测出49～59个重复序列,鉴定出139～163个SSR位点且单碱基重复居多数。序列多样性比对表明,非编码序列在各物种间的差异性较大。此外,筛选到2个核苷酸多样性较高的基因,即clpP和ycf1。通过Maximum likelihood（ML）构建的系统发育树表明,Medicago edgeworthii（毛荚苜蓿）、Medicago archiducis-nicolai（青海苜蓿）和Medicago ruthenica（扁蓿豆）亲缘关系较近。

分类号： S54

  • 相关文献

[1]花园君子兰叶绿体基因组序列. 吴海红,李丹,冯秀丽,岳玲,赵兴华. 2023

[2]基于重测序的籽粒型和鲜食型大豆的全基因组变异分析. 郭丹丹,袁凤杰,郁晓敏. 2019

[3]三代测序技术及其应用研究进展. 马丽娜,杨进波,丁逸菲,李颖康. 2019

[4]18个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析. 施肖堃,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华. 2019

[5]苜蓿属植物的黄酮类化学成分研究概况. 何春年,李展,高微微,佟建明. 2006

[6]蔬菜史话·菜苜蓿. 张德纯. 2011

[7]基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘. 张彦威,李伟,张礼凤,王彩洁,戴海英,徐冉. 2016

[8]中国苜蓿属植物适宜性区划. 徐丽君,徐大伟,逄焕成,辛晓平,金东艳,唐雪娟,郭明英. 2017

[9]苜蓿属物种分类研究进展. 刘志鹏,任广朋. 2022

[10]三倍体香蕉优良品种‘Grand Nain’全基因组变异挖掘. 邵秀红,胡春华,盛鸥,毕方铖,邓贵明,杨乔松,易干军. 2018

[11]木薯MeNCED3基因克隆、结构变异及其表达分析. 丁泽红,付莉莉,铁韦韦,颜彦,胡伟. 2016

[12]紫花苜蓿. 张文淑. 2002

[13]苜蓿属植物的皂苷类化学成分. 何春年,高微微,佟建明. 2005

[14]菜苜蓿. 张德纯. 2011

[15]中国苜蓿属植物与新疆苜蓿种质资源的优势. 李捷,张清斌,杨刚. 1997

[16]苜蓿属植物苗期耐盐指标筛选及耐盐性综合评价. 田小霞,毛培春,张琳,郭强,孟林. 2018

[17]新疆野生苜蓿属种质资源表型变异分析. 郑兴卫,李聪. 2017

[18]苜蓿抗旱性分子研究进展. 李倩,江文波,王玉祥,张博,庞永珍. 2021

[19]2Ai-2染色体在小麦部分同源染色体代换背景中的遗传. 张悦,林志珊,曹保久,郭义强,王美蛟,叶兴国,辛志勇,徐琼芳,郭世华. 2009

[20]苜蓿属分类学研究动态及对中国苜蓿属分类研究的初步探讨. 申玉龙. 1993

作者其他论文 更多>>

微信小程序