苜蓿属不同物种叶绿体基因组结构比较及亲缘关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田春育

作者： 田春育;李志勇;刘倩;于林清;武自念

作者机构：

关键词： 苜蓿属;叶绿体全基因组;结构变异;系统发育

期刊名称： 中国草地学报

ISSN： 1673-5021

年卷期： 2021 年 010 期

页码： 1-8

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以苜蓿属24个种1个亚种叶绿体基因组为研究对象,利用REPuter、mVISTA和MAFFT等分析叶绿体基因组的重复序列、序列变异情况及进化关系。结果表明,苜蓿属不同种间叶绿体基因组介于121313～132269bp之间,编码110～118个基因,基因数目的差异主要是因蛋白编码基因数目不一所致。在苜蓿叶绿体基因组中共检测出49～59个重复序列,鉴定出139～163个SSR位点且单碱基重复居多数。序列多样性比对表明,非编码序列在各物种间的差异性较大。此外,筛选到2个核苷酸多样性较高的基因,即clpP和ycf1。通过Maximum likelihood（ML）构建的系统发育树表明,Medicago edgeworthii（毛荚苜蓿）、Medicago archiducis-nicolai（青海苜蓿）和Medicago ruthenica（扁蓿豆）亲缘关系较近。

分类号： S54

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