利用小亚基核糖体RNA技术分析温室黄瓜近根土壤古菌和真菌多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵志祥

作者： 赵志祥;芦晓飞;陈国华;茆振川;杨宇红;刘二明;谢丙炎

作者机构：

关键词： 土壤微生物群落;古菌16S rRNA基因;真菌18S rRNA基因;系统进化发育分析

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2011 年 27 卷 01 期

页码： 41-51

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 土壤古菌和真菌在温室生态系统是仅次于细菌的微生物,具有类似于细菌的重要生态功能。通过构建古菌16S rRNA和真菌18S rRNA基因克隆文库,分析温室黄瓜近根土壤古菌和真菌群落结构组成,为开发利用温室这一特殊的生态环境中丰富的微生物资源以及理解微生物与植物间的互作提供参考依据。采用研磨-冻融-溶菌酶-蛋白酶K-SDS热处理以及CTAB处理等理化方法,提取和纯化微生物总DNA,构建古菌16S rRNA和真菌18S rRNA基因克隆文库。利用DOTUR软件将古菌和真菌序列按照相似性97%的标准分成若干个可操作分类单元(OTUs)。土壤古菌克隆文库主要包括泉古菌门和未分类的古菌两大类,并有少部分广域古菌类群,所有泉古菌均属于热变形菌纲,共45个OTUs;真菌克隆文库包括真菌门的大多数亚门真菌,共24个OTUs,未发现担子菌亚门真菌。古菌多样性比较丰富,且发现少量的广域古菌(甲烷菌),这一情况可能与温室长期高温高湿,高有机质含量,土壤处于缺氧环境有关;土壤真菌的优势种群为子囊菌,占到土壤真菌的80%以上,这可能与绝大多数植物真菌性病害属于土传病害,通过菌丝体、菌核或子囊壳在土壤病残体中越冬有一定的关系。

分类号： S154.3`S642.2`S626

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