基于Meta分析的大豆百粒重的QTLs定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 齐照明

作者： 齐照明;孙亚男;陈立君;郭强;刘春燕;胡国华;陈庆山

作者机构：

关键词： 大豆;百粒重;Meta分析;通用QTL;MAS

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2009 年 42 卷 11 期

页码： 3795-3803

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】百粒重是控制大豆产量性状的主要数量性状,对大豆产量性状进行基因定位具有重要的研究和应用价值。现有百粒重QTL定位结果分散,需选择合适的公共图谱,整合前人的研究结果,使其真正应用到实践中。【方法】以2004年发布大豆公共遗传连锁图谱soymap2为参考图谱,将近20年不同试验中的大豆百粒重的QTLs进行映射整合,构建百粒重QTL综合图谱。利用BioMercator2.1的映射功能将国内外常用的大豆图谱上的百粒重QTLs通过公共标记映射整合到大豆公共遗传连锁图谱soymap2上,并利用Meta分析,通过对比已经报道的QTLs的95%的置信区间来推断QTL位置,从而提取真正有效的QTL标记。【结果】在已经发表的文献中共找到65个百粒重QTLs定位信息,其中有53个QTLs定位区间与公共图谱有共有标记,包括36个增效效应的QTLs和17个减效效应的百粒重QTLs,共得到12个QTL簇,通过Meta分析,发掘出6个增效效应和6个减效效应的百粒重"通用QTLs"及其连锁标记。【结论】本研究得到的"通用QTLs"其置信区间最小可达到1.52cM,为辅助选择分子标记、QTL精细定位以及数量性状基因的克隆奠定基础。

分类号： S565.1

  • 相关文献

[1]大豆重组自交系群体NJRSXG百粒重超亲分离的遗传解析. 张英虎,孟珊,贺建波,王宇峰,邢光南,赵团结,盖钧镒. 2015

[2]大豆落荚瘪荚和粒重降低的原因与对策. 董全中. 2009

[3]大豆百粒重相关基因的全基因组发掘分析. 宿洋,杨静,郭勇,杜维俊,邱丽娟. 2021

[4]大豆百粒重相关分子标记的实用性分析与验证. 任海红,刘学义,朱保葛,林汉明. 2014

[5]大豆不同亲本正反交F_3、BC_1F_2百粒重遗传规律研究. 曹永强,王海英,张惠君,王文斌,宋书宏,谢甫绨. 2008

[6]群体构成方式对大豆百粒重全基因组选择预测准确度的影响. 马岩松,刘章雄,文自翔,魏淑红,杨春明,王会才,杨春燕,卢为国,徐冉,张万海,吴纪安,胡国华,栾晓燕,付亚书,王曙明,韩天富,张孟臣,张磊,苑保军,郭勇,Jochen C.REIF,江勇,李文滨,王德春,邱丽娟. 2018

[7]大豆蛋白及百粒重QTL研究进展. 潘文婧,王金星,王乔,孙亚男,高陆思,曲梦楠,张维耀,付春旭,姜世波,姜成喜,付亚书,景玉良. 2022

[8]熟期与品质性状对东北大豆发芽率影响的研究. 范旭红,孟凡凡,郑宇宏,张云峰,孙星邈,王明亮,王曙明. 2015

[9]基于高密度Bin图谱的大豆百粒重QTL定位和候选基因分析. 葛天丽,田宇,张皓,刘章雄,李英慧,邱丽娟. 2022

[10]川渝地区地方和育成大豆品种籽粒性状关联分析. 杨红燕,何庆元,张英虎,杨华伟,向仕华. 2021

[11]大豆百粒重QTL定位及多样性评价. 陈强,闫龙,冯燕,邓莹莹,侯文焕,刘青,刘兵强,杨春燕,张孟臣. 2016

[12]基于高能碳离子辐射的野生大豆突变群体百粒重GWAS分析. 刘秀林,赵克臻,王雪扬,张丰屹,袁荣强,张春蕾,任洪雷,苗丽丽,王家军,张必弦. 2025

[13]大豆共生结瘤相关性状QTL定位信息整合及候选基因分析. 张艳娇,李长育,王锦辉,常慧琳,魏玮,马超,姜志浩,蒋洪蔚,刘春燕,尹振功,高山,金喜军,辛大伟,陈庆山. 2017

[14]大豆根长QTL的Meta分析及候选基因挖掘. 刘鑫,甄善继,王家军,王洋. 2023

[15]大豆荚粒数相关QTL的Meta和Overview分析及其候选基因预测. 李莹莹,李瑞超,程春光,赵圆圆,刘春燕,齐照明,李灿东,王囡囡,蒋洪蔚,陈庆山. 2018

[16]施用钼肥对大豆生长性状、产量和品质影响的Meta分析. 张立强,张景勇,孙宇,贺斌斌,张伟,陈迪,朴仁哲,赵洪颜. 2022

[17]水稻抗白叶枯病基因Xa23群体的MAS育种研究. 于洁,王耀雯,马文清,王建岭,王育荣,赵开军,王春连,刘丕庆. 2010

[18]分子遗传技术在家畜遗传评定中的应用. 狄江,王琼,拉扎提. 2009

[19]基于抗稻瘟病基因Pi40特异性SCAR标记的MAS育种应用. 寇姝燕,邓剑川,邹茜,刘慰华,张翠萍,朱振华,陈于敏,赵国珍,苏振喜,世荣,袁平荣. 2019

[20]抗稻瘟病恢复系黔恢101选育及安优101的应用. 张习春,孙建华,王倩,王洪亮,李佳丽,张大双,朱速松. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序