福建省马铃薯纺锤块茎类病毒快速检测及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李华伟

作者： 李华伟;罗文彬;纪荣昌;许泳清;张鸿;李国良;刘中华;邱永祥;邱思鑫

作者机构：

关键词： 福建省;马铃薯;马铃薯纺锤块茎类病毒;RT-PCR;检测

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2015 年 30 卷 10 期

页码： 984-988

摘要： 为检测福建省马铃薯纺锤块茎类病毒及了解其分子变异情况,以感染马铃薯纺锤块茎类病毒的植株为试验材料,提取RNA,反转录cDNA,利用设计合成的特异性引物进行RT-PCR检测,扩增产物经回收纯化后克隆和测序。结果表明,PCR扩增出359bp的特异片段,将扩增产物经回收和纯化并进行克隆与测序,测序结果经BLAST比对后,该片段为PSTVd基因序列,PSTVd分离物命名为Fujian PTSTd(KM588065.1),与国内外报道的PSTVd分离物同源性达98%以上。该分离物与弱毒株系(M14814.1)、中间株系(AY492084.1)和强毒株系(U23058.1)比对,有11个核苷酸具有多态性,其中5个发生在致病区。不同国家和地区序列进化树分析表明,该分离物与我国北方及欧美国家分离物亲缘关系最近,与新西兰分离物亲缘关系最远。

分类号： S435.32

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