粤东海域褐菖鲉种群线粒体DNA控制区序列变异及其在平鲉亚科中的分类地位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 苏天凤

作者： 苏天凤;江世贵;张殿昌;周发林;黄建华;朱彩艳;杨丽诗

作者机构： 中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词： 褐菖鲉;线粒体DNA;遗传变异;分子系统

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2012 年 33 卷 02 期

页码： 3-10

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对捕自粤东海域的47尾野生褐菖鲉Sebastiscus marmoratus线粒体DNA控制区序列进行了扩增和序列变异分析,并结合GenBank中10种其他平鲉亚科的同源序列,分析了平鲉亚科的分子系统。结果表明,所获序列长度在538～544bp之间,具69个碱基替换位点和36个插入/缺失位点;控制区碱基组成中,A、T、C、G含量分别为34.5%、29.0%、15.8%、20.7%。共检测到38个单倍型。该种群的单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.978和0.0192。以鲉亚科棘鲉Hoplosebastes armatus作为外群构建的分子系统树显示,褐菖鲉为11种平鲉亚科中较早分化出的种,位于进化树的基部;平鲉亚科为单系群,分为4个分支,分别为平鲉属Sebastes、菖鲉属Sebastiscus、眶棘鲉属Hozukius和无鳔鲉属Helicolenus,与传统的分类地位一致。研究结果表明,控制区序列不仅适合褐菖鲉种群遗传多样性研究,同样也适合分子系统发育研究。

分类号： S917.4

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