产茸相关SNP位点在7个梅花鹿群体中的验证
文献类型: 中文期刊
第一作者: 田雪琪
作者: 田雪琪;李洋;刘汇涛;王天骄;邢秀梅
作者机构:
关键词: 梅花鹿;产茸性能;SNP;相关性分析;群体验证
期刊名称: 特产研究
ISSN: 1001-4721
年卷期: 2021 年 43 卷 005 期
页码: 41-47
摘要: 本试验对东大、四平梅花鹿两个群体中所筛选出的8个产茸量相关SNP位点,运用竞争性等位基因特异性PCR分型技术(KASP),在7个梅花鹿群体的190头梅花鹿个体中进行验证.结果 表明,7个位点具有多态性,其中SNP1427_ 255427_ 255、SNP307_ 1564、SNP123_ 7847和SNP2027_ 423为中度多态性位点,SNP614_2585、SNP1881 _130和SNP596_ 3774为低度多态性位点,SNP219 _9123是CC基因型的单态位点;最小基因等位基因频率(MAF)介于0.049~0.396之间,平均值为0.188;各位点的观测杂合度(Ho)介于0.09~0.426,平均值为0.265;期望杂合度(He)介于0.082~0.49之间,平均值为0.282;多态信息含量(PIC)介于0.078~0.369,平均值为0.232;有效等位基因数(Ne)介于1.2~2.8,平均值为1.9.7个多态性位点中,SNP614_2585、SNP1881_ 130和SNP596_3774位点偏离Hardy-Weinberg平衡.一般线性模型对多态性SNP位点与产茸量进行关联分析,发现所验证的7个位点对产茸量的影响均不显著,但SNP307_ 156、SNP614_258和SNP596_ 377位点存在高产基因型.本研究为产茸量相关SNP的实际应用提供理论依据.
分类号: S825
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