四株不同宿主来源的Class I基因3型新城疫病毒全基因组序列测定及比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 金仕强

作者： 金仕强;孟春春;邓俊良;张向乐;仇旭升;谭磊;于圣青;左之才;丁铲

作者机构：

关键词： 新城疫病毒;Class I;全基因组序列;不同宿主来源

期刊名称： 病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 2012 年 28 卷 004 期

页码： 394-402

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解析基因型相同但宿主来源不同的新城疫病毒的全基因组差异.本文采用RT-PCR方法分别获得4株(JS/3/09/Ch,ZJ/3/10/Ch,AH/2/10/Du,JS/9/08/Go)Class I基因3型病毒的全基因组核苷酸序列,并与GenBank中已公布的Class I基因3型病毒全基因组序列进行比对分析.本实验4株病毒的基因组长度均为15 198bp,在基因组1 607~1 608位有6碱基的缺失,在2 381~2 382位有12碱基的插入,裂解位点为11 2EQ/RQE/GRL117是标准弱毒特征.5株ClassI基因3型病毒之间全基因组同源性超过93%;而与Class Ⅱ弱毒株同源性最低只有72.2%;比较6个结构蛋白基因的同源性,NP基因的同源性最高(98.3%~96.4%),而P基因最低(96.1%~91.9%).结果表明不同宿主来源的Class I基因3型新城疫病毒在遗传信息方面差异不大,但NP/F/L基因的变异幅度较P/M/HN基因明显.

分类号： S852.65+9.5

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