苎麻基因组微卫星的分离与鉴定(英文)

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蒋彦波

作者： 蒋彦波;揭雨成;周建林;邢虎成;佘玮

作者机构：

关键词： 苎麻[Boehmeria nivea (L.) Gaud];微卫星;磁珠;基因组文库;(GA)n重复序列

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2007 年 33 卷 01 期

页码： 158-162

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud.]栽培品种芦竹青为材料,经MseⅠ酶切并与相应接头连接,然后与生物素标记的探针(CT)15杂交,再用链亲和素包被磁珠(Dynabeads M-280)捕捉杂交产物,以21碱基接头寡核苷酸为引物经PCR扩增获得了双链目的片段,回收300~1 000 bp DNA片段,然后克隆到pMD18-T载体上,转化至DH5α中,这样就构建了苎麻富含(GA)n微卫星的部分基因组文库。随机挑取36个克隆,以锚定简单重复序列为引物对其进行PCR筛选。测序分析了22个阳性克隆,每个克隆都含有微卫星DNA,阳性克隆率为61.1%,微卫星种类以与探针互补的(GA/CT)n为主,占83.3%,同时还存在(TG/AC)n和三碱基、六碱基为单元构成的苎麻微卫星,如(GAC)n、(ACG)n、(TCT)n、(TCG)n、(GAA)n(、CCGACG)n(、GAGAAA)n等。最后以18个微卫星位点设计了18对苎麻微卫星特异引物。GA/CT重复单元的长度从7到40范围内变化,平均为19.2,显示了它们将产生良好多态性,为一种强有力的遗传标记。苎麻微卫星DNA标记可广泛应用于苎麻基因型鉴定,基因和QTL分析,分子标记辅助育种,系谱分析等。

分类号： S563.1

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