类乌齐牦牛SIRT3基因克隆与生物信息学及差异表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 杨玉梅

作者: 杨玉梅;柴志欣;王会;王吉坤;信金伟;姬秋梅;钟金城

作者机构:

关键词: 类乌齐牦牛;SIRT3基因;克隆;生物信息学分析;组织表达

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 56-62

收录情况: 北大核心

摘要: 本实验旨在丰富牦牛SIRT3基因的基础研究,通过对西藏类乌齐牦牛SIRT3基因克隆、生物信息学分析及差异表达分析,进一步探讨SIRT3基因的生理功能及分子机制。结果表明:类乌齐牦牛SIRT3基因CDS区长1002bp,编码333个氨基酸,与普通牛SIRT3基因CDS区比对存在碱基突变,编码氨基酸发生错义和同义突变,同义突变发生在碱基第49、279、342、384位,错义突变发生在碱基第149和620位,其编码蛋白属亲水性蛋白,有多个跨膜区域和磷酸化位点,无信号肽片段,主要位于线粒体,二级结构以无规卷曲和α-螺旋为主;SIRT3基因编码蛋白在催化活性、核苷酸结合及辅因子结合等过程发挥主要功能,主要参与生物体代谢过程;类乌齐牦牛SIRT3基因序列与普通牛一致性较高,亲缘关系最近;QPCR分析显示,SIRT3基因在牦牛肝脏中的表达水平极显著高于其他组织(P<0.01)。

分类号: S823.85

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