北京黑猪LPL和NUDT3基因多态性及其与肉质性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 苏艳芳

作者： 苏艳芳;牛乃琪;宗文成;刘先策;刘海;石国华;井西涛;张龙超

作者机构：

关键词： 北京黑猪;NUDT3基因;LPL基因;肉品质;关联分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN：

年卷期： 2024 年 003 期

页码： 1111-1121

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究脂蛋白脂酶（lipoprteinlipase, LPL）和Nudix水解酶3（Nudix hydrolase homolog 3,NUDT3）基因多态性与北京黑猪肌内脂肪（intramuscular fat, IMF）含量和背膘厚的关联性，从而在分子水平上指导北京黑猪的育种工作。【方法】利用347头北京黑猪背最长肌样本进行IMF含量和背膘厚数据测定，按照IMF含量进行高、低分组。根据猪NUDT3和LPL基因序列设计引物并进行PCR扩增及测序，运用DNAStar软件中SeqMan分析测序结果，使用Duncan’s多重检验对2个基因不同基因型与北京黑猪IMF含量和背膘厚进行关联分析，并运用实时荧光定量PCR对其进行基因表达差异分析。【结果】LPL基因存在1个错义突变、3个同义突变和3个3′-UTR突变；NUDT3基因存在6个3′-UTR突变。LPL基因CDS区c.431 G＞C位点与北京黑猪第6～7肋背膘厚显著相关，c.647 G＞C位点与胸腰结合处背膘厚显著相关，c.637 A＞G位点与第6～7肋背膘厚、胸腰结合处背膘厚和腰荐结合处背膘厚均显著相关（P＜0.05）;3′-UTR区c.1683 A＞G位点与胸腰结合处背膘厚显著相关，c.1689 C＞A位点与IMF含量显著相关（P＜0.05）。NUDT3基因上的突变位点均发生在3′-UTR区，其中c.7204 G＞T位点与北京黑猪IMF含量和腰荐结合处背膘厚显著相关，c.6068 C＞G位点与IMF含量和第6～7肋背膘厚显著相关，c.5729 G＞A位点与IMF含量显著相关（P＜0.05）。实时荧光定量PCR分析发现，北京黑猪NUDT3基因c.7204 G＞T位点IMF含量高、低组间表达量无显著差异，LPL基因c.1689 C＞A位点CC与AA基因型间表达量无显著差异（P＞0.05）。【结论】北京黑猪群体中LPL和NUDT3基因的突变位点与IMF含量显著关联，为北京黑猪肉品质选育提供了新的分子标记。

分类号： S828.2

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