利用SNP标记分析淳安花猪群体遗传多样性和群体结构

文献类型： 中文期刊

第一作者： 戴丽荷

作者： 戴丽荷;褚晓红;陈晓宇;杨娜娜;黄孙平;徐如海

作者机构：

关键词： SNP芯片;淳安花猪;遗传多样性;群体结构;家系

期刊名称： 养猪

ISSN： 1002-1957

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 59-64

摘要： 利用Illumina CAUPorcine 50K SNP芯片检测54头淳安花猪的单核苷酸多态性（SNP）,分析群体遗传多样性和群体结构。结果显示,共检测到44 739个SNP位点,个体的平均基因型检出率为98.49%;通过质控的SNP位点有32 713个,其中54.3%具有多态性;平均有效等位基因数为1.355,平均多态信息含量为0.193,最小等位基因频率平均为0.143;平均观察杂合度为0.254,平均期望杂合度为0.257;平均IBS（状态同源）遗传距离为0.212 9,其中公猪为0.233 9;ROH（基因组长度纯合片段）共有2 646个,65%的长度在400～700 Mb之间,平均近交系数为0.199;54头淳安花猪可划分为6个家系,各家系的个体数量差异明显。综上所述,淳安花猪保种群体的杂合度低,近交程度高,家系少,各家系的个体数量差异大,容易引起遗传多样性的丢失。在后续保种过程中,应根据划分的家系进行选种选配或引入血统,以确保淳安花猪遗传资源的长期保护。

分类号： S828

  • 相关文献

[1]169份不同遗传背景玉米自交系的遗传多样性分析. 邹成林,黄开健,黄爱花,莫润秀,翟瑞宁,杨萌,韦新兴. 2025

[2]国内虹鳟代表性养殖群体的高通量SNP芯片检测及遗传分析. 赵紫霞,许建,白庆利,杨世勇,蒋立坤,陈葆华,Palti Yniv,Gao Guangtu,徐鹏. 2018

[3]基于SNP芯片的云南玉米自交系遗传多样性和群体遗传结构分析. 张鹏,管俊娇,黄清梅,杨晓洪,张建华,康祝科. 2020

[4]基于SNP芯片分析新浦东鸡的遗传多样性和遗传结构. 齐丽娜,陆雪林,杨凯旋,周瑾,李先玉,刘珂,张文刚,顾欣,章伟建. 2023

[5]利用高密度SNP芯片分析杭猪的群体遗传结构. 刘晨龙,卢丹,周泉勇,万明春,郝晓东,张献贺,郑瑞强,季华员. 2022

[6]"酉芯一号"在地方鸡遗传多样性和结构分析中的应用效力研究. 王梦燏,周成浩,薛倩,殷建玫,蒋一秀,张会永,李国辉,韩威. 2024

[7]基于SNP芯片的丫杈猪保种群体遗传结构研究. 陶璇,杨雪梅,梁艳,刘一辉,汪勇,孔繁晶,雷云峰,杨跃奎,王言,安瑞,杨坤,吕学斌,何志平,顾以韧. 2023

[8]基于50K SNP芯片评估广东省四类地方猪保种群体的遗传结构. 程昕琰,王诗媛,吉叶标,黄思秀,杨杰,孟繁明,张茂,蔡更元,刘琅青. 2024

[9]中国对虾家系水平遗传多样性的AFLP分析. 孟鹏,刘晓敏,王伟继,孔杰,李晓静,王清印. 2008

[10]利用TRAP标记分析8个福瑞鲤家系的遗传多样性. 丁敬波,董在杰,朱文彬,苏胜彦,公翠萍,阎明信. 2014

[11]利用微卫星标记比较分析拟穴青蟹不同家系的遗传多样性. 崔海玉,马洪雨,马春艳,乔振国,马群群,亓磊,沈盎绿,马凌波. 2011

[12]五个家系吉富罗非鱼的遗传多样性分析. 陈文华,李建林,徐跑,俞菊华,唐永凯. 2009

[13]凡纳滨对虾SNP标记开发与家系亲缘关系验证分析. 刘峻宇,刘均辉,孔杰,代平,于洋,孟宪红,罗坤,曹宝祥,陈宝龙,高焕,栾生. 2021

[14]西南地区小麦抗条锈病种质的遗传多样性及群体结构分析. 陈天青,黄芳,李文贞,蒋选利,王伟,刘冬成,阳文龙,张爱民,张立异. 2015

[15]湖南新田大冠岭野生大豆居群遗传结构与空间分布关系. 赵青松,赵云云,王朋,邓小娟,马启彬,年海,杨存义. 2014

[16]华北生态群普通杏遗传多样性与群体结构分析. 章秋平,刘冬成,刘威生,刘硕,张爱民,刘宁,张玉萍. 2013

[17]基于分型测序技术的粒用高粱遗传多样性和群体结构分析. 汪灿,周棱波,高旭,张国兵,程斌,曹宁,丁延庆,徐燕,邵明波,张立异. 2019

[18]甘蓝型油菜2009-2010年候选品种遗传多样性及群体结构. 许鲲,谷铁城,刘凤兰,李浩,陈碧云,高桂珍,伍晓明. 2012

[19]不同来源中国李(Prunus salicina L.)的多样性与近缘种关系. 魏潇,章秋平,刘宁,张玉萍,徐铭,刘硕,张玉君,马小雪,刘威生. 2019

[20]基于表型性状和SSR标记的山西省青狗尾草资源遗传多样性分析. 张耀元,任彦鑫,禾璐,张雁明,张彬,王兴春,李红英,韩渊怀. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序