中国对虾SRAP分子标记体系正交优化及在遗传多样性分析中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈华增

作者： 陈华增;李健;何玉英;李吉涛;王清印

作者机构：

关键词： 中国对虾;正交设计;SRAP;遗传多样性

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2010 年 31 卷 06 期

页码： 43-53

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用正交设计L16(45)对影响中国对虾SRAP分子标记分析的5个因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP和引物浓度)在4个水平上进行了优化,筛选出各反应因素的最佳水平为:20μl反应体系中包含1.0UTaq酶,2.0mmol/L的Mg2+,40.0ng的模板DNA,0.125mmol/L的dNTP以及0.4μmol/L的引物,退火温度为53.5℃。研究表明,各因素的不同水平对扩增结果有显著影响,其中Mg2+影响最大,影响大小顺序依次为Mg2+,Taq酶,引物,dNTP和模板DNA。利用优化的SRAP分子标记体系对中国对虾"黄海1号"第12世代选育群体进行了遗传多样性分析,实验结果表明,此标记技术可作为中国对虾遗传分析的良好技术工具。遗传多样性分析共筛选出8对可以扩增出清晰稳定条带的引物组合,共获得171个位点,其中多态性位点154个,占90.08%;有效等位基因数为1.7741,期望杂合度均值为0.4219,Shannon多样性指数为0.6055。上述参数值均高于应用AFLP技术对前几代选育群体的遗传多样性分析结果。

分类号： S917.4

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