利用siRNA高通量测序和RT-PCR技术鉴定引起茄子斑驳紫花病的病毒种类

文献类型： 中文期刊

第一作者： 柴阿丽

作者： 柴阿丽;陈利达;曹金强;康华军;石延霞;谢学文;李宝聚

作者机构：

关键词： 茄子斑驳紫花病;siRNA高通量测序;分子鉴定;烟草轻型绿花叶病毒;番茄斑驳花叶病毒

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2019 年 03 期

页码： 508-518

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了明确引起茄子斑驳紫花病的病毒种类,利用小干扰RNA(si RNA)高通量测序技术,结合生物信息学方法寻找茄子样本中的病毒序列,发现存在烟草轻型绿花叶病毒(Tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)。为了验证该结果,对待测样品中TMGMV和ToMMV的外壳蛋白(coatprotein,CP)全长基因进行RT-PCR扩增和系统进化分析,分别得到500bp的TMGMV-CP和482bp的ToMMV-CP特异性条带,与GenBank中TMGMV和ToMMV序列相似性分别达到98%～100%和100%,说明待测样品中确实存在TMGMV和ToMMV。对采自山东、河南、辽宁、河北等地的23份疑似斑驳紫花病茄子样品,分别采用特异性引物524-F/R和ToMMV-F/R进行检测。结果显示,所有样品中均含有TMGMV,20份样品中含有ToMMV,复合侵染检出率为86.96%。对茄子、番茄和辣椒幼苗的致病性检测显示,接种后茄子花表现出与田间相同的症状,茄子、番茄和辣椒的叶片表现典型的病毒侵染症状,在接种发病组织中检测到病毒ToMMV和TMGMV。结果表明,茄子斑驳紫花病样中鉴定出TMGMV和ToMMV两种病毒。

分类号： S436.411

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